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转录组Count数据差异分析工具

当我们拿到表达谱数据之后，做差异分析之前，有两个关键信息需要确认，一个是 数据类型（芯片数据、FPKM、TPM、Count）,一个是 哪些样本作为参照物，哪些样本作为 处理组样本，也就是 谁相对于...

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• admin 发布于 2021-08-19 11:40

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零代码对不同类型的RNA Seq数据进行差异分析

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。本节主要讲解TCGA中不同类型RNA-Seq数据差异分析方法。

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• 调研图 发布于 2018-11-16 13:31

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DECenter:简便的差异分析工具使用教程

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• 调研图 发布于 2018-07-12 20:44

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多套数据集我们分别筛完了差异该怎么去整合？

之前讲到通过DEcenter做差异分析，利用多套数据集都得到各自的差异基因，简单粗暴的可以通过Veen图的方法观察多套数据集中同时差异的基因，通过RRA算法简易实现工具来尝试更为合理整合方法。

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• 调研图 发布于 2018-06-15 17:41

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拿TCGA肝癌的RNA-Seq数据来做差异分析例子

刚写了一篇如何用GEO数据来做差异的例子如：https://www.shengxin.ren/article/207 这次来用TCGA的肝癌的数据来演示以下，我们选择大家比较喜欢的RNA-Seq Counts数据 使用TCGA简易下载工具选...

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• 祝让飞 发布于 2017-10-26 20:27

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拿一套GEO数据集用DECenter来花式做差异详解

之前很多人使用DECenter出现各种奇奇怪怪的错误，然后程序猿一直希望将学习成本降到最低，经过多次努力，已更新到了第四版本 这次就用V4来做一下一套GEO芯片数据的差异分析 这套芯片数据为：G...

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• 祝让飞 发布于 2017-10-26 15:20

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如何极其简单的使用GEO数据来做差异分析

无论你是要看某个基因是否差异表达或者筛选某个GEO数据集的差异基因，这个方法绝对能够帮助你事半功倍 首先假设你已经找到了一套数据GSE32323 这套数据共包含44个样本，其中有17个配对的癌与...

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• 祝让飞 发布于 2017-09-28 10:48