暂无介绍
参考文献 Wagner, G.P., Kin, K. & Lynch, V.J. Measurement of mRNA abundance using RNA-seq data: RPKM measure is inconsistent among samples. Theory Biosci. 131, 281–285 (2012).
分析报告的模板定制与自动生成
一、分析流程的批量运行顺序 二、分析流程的过程控制
前文链接: 图形化生物信息分析系统开发 - 1 需求分析及技术实现 图形化生物信息分析系统开发 - 2 样本信息处理 图形化生物信息分析系统开发 - 3 生信分析pipeline的进化 图形化生物信息分...
变量处理:要实现pipeline图形设计器,首先要先对用到的变量,做统一的设计 分析步骤/节点设计:前文提到,生信分析pipeline其实就是基于文件输入输出的工作流,这里对工作流做了简化,归纳起来工作流中有4种节点。 工作流设计: 最后,有了变量,和节点,最后就是工作流的设计了。用连接线,将以上4中节点连接起来,计算相互之间的依赖关系,用统一的格式保存起来。
接上两篇内容,本文主要讲述工作中NGS从科研进入医学临床领域,工作中接触到生信流程,以及最终在自动图形化开放式生信分析系统开发中生信workflow设计实现的过程。 1.手动命令行运行 2. 脚本连续运行 3.一个脚本 shell 文件运行整个分析流程 4. 自动扫描文件并运行脚本 5. 带报告的自动扫描并触发运行脚本
生信分析云平台开发 - 2样本信息处理
在pubmed上利用TCGA的数据及CeRNA假说整合分析所发表的文章已经快五十篇了,他们从不同程度上来诠释CeRNA假说以及应用场景,我们都知道ceRNA全称为competing endogenous RNA,是一种能够竞争结...
昨天我们发布了第24期福利活动 如何真正做到“零基础、零代码、高质量”跨界生物信息学 按照活动规则,在今日12点整留言处排名 为了尽可能杜绝刷票,我们将由工作人员拉群,以抢红包
视频教程讲解基因家族分析方法,真正做到“用别人的数据,发自己的文章”!