strings 的回答 - 生信人

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RNA-Seq数据的Merge_Matrix.txt.cv.txt文件

是excel导致的，excel会自动把类似日期的字符转换为日期格式，如“march8”变为“8-Mar”。

回答于 2017-12-05 19:50

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使用GEO2R在线软件分析的数据是否是原始数据？

GEO2R是提供源码的，可以看到读取的是GEO的matrix文件。即，标准化后数据。

回答于 2017-12-05 11:14

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用DEGseq用R包进行差异基因表达的perl脚本/

R包就在R软件里分析即可。最好不要用perl来调用，不方便调试代码。

回答于 2017-12-05 11:11

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基因突变的鉴定

‘基因突变’，对应的英文是‘mutation’。这个概念的意思是单个碱基发生了变异。所以，该概念和“这个基因发生突变”这类描述无关。如果硬要如此表述，则可以认为“至少一个位点出现mutation，即可认为该基因发生突变”。针对某个基因在两个样本出现mutation不一样，是很正常的，代表了“遗传多样性”，这些突变，可能是功能...

回答于 2017-12-05 11:10

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GEO下载数据包括病毒感染肿瘤，非病毒感染肿瘤和正常三种数据，...

类似HBV感染的HCC、非HBV感染的HCC、正常对照。一般是分别做差异的。 1. 通常文章标题中出现研究HBV感染HCC的，会分析"HBV感染的HCC" v.s. "HBV长期感染者" 2. 假装不知道HBV感染的，会分析（“HBV感染的HCC" + “非HBV感染的HCC”） v.s. “正常对照” 3. 研究非HBV感染HCC的，会分析“非HBV感染的HCC” v.s. “正常对照”

回答于 2017-12-04 16:58

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