祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期
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illuminaga_rnaseqv2-RSEM_genes  (MD5) illuminahiseq_rnaseqv2...

测序平台不同，你下载下来看一下矩阵中的样本数，两种都能做差异分析，看你的差异方法对数据的要求是怎么样的

回答于 2018-10-11 21:44

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下载的miRNA数据有很多0，请问大神们，这样的0值是当NA处理吗

需要删掉在各个样本中0很多的miRNA，剩下的当0处理就好

回答于 2018-10-11 21:42

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TCGA简易下载工具v14中的甲基化数据和CNV数据下载后，都是转化好...

没有转化的呢，都是原始的，这里你可以下载.nocnv的

回答于 2018-10-11 21:40

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TCGA简易下载工具v14中不同数据类型的含义

nocnv是经过背景矫正的，你可以参考一下：https://shengxin.ren/article/98

回答于 2018-10-11 21:39

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从firebrowse上下载tcga转录组学的数据，是具体选择哪些呢？见下...

看你自己的需求，我猜测你下载倒数第二个就可以

回答于 2018-10-11 21:36

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GEO数据的CDF文件下载不了

打开你那个平台的GEO主页面，截图位置：

回答于 2018-10-09 12:38

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想问一下，用小工具下载的RNA-seq数据的平台是什么，是Illiumina...

是level3的，平台是IlliuminaHiSeq

回答于 2018-10-09 12:11

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用TCGA 胃癌数据，运行单基因的GSEA,最后看不到在运行，也未报错...

检查一下 sangerbox软件的路径是否带有特殊字符，还有数据保存目录是否有特殊字符，如果有的话更改目录即可

回答于 2018-10-09 11:19

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Treeview绘制热图时，如何制作颜色标尺？

用AI 自己加上去就行

回答于 2018-10-09 11:13

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芯片有3个分组：疾病+治疗组，疾病+未治疗组，正常人组，差异分...

你把 疾病+治疗组 定义成一个新的组别 不就可以了嘛

回答于 2018-10-09 10:53