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GSEA
GSEA是富集的方法，KEGG\GO是功能数据库，两者并没有包不包含的关系，日常用法是：使用GSEA方法对KEGG\GO进行功能富集分析。 MsigDB：是专门针对GSEA这种方法而建立的数据库，H 或者C5 C3 是不同的功能的背景数据库，可以与KEGG\GO类似，你想做什么分析就用什么。 所以 你先整明白富集分析再回头看這些问题可能会好理...
回答于 2018-11-21 09:58
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y <- DGEList(counts=data,group=group) Error in .isAllZero(co...
你这个问题应该是基因没有匹配上从而存在NA问题，也就是说你的数据预处理时没有处理正确，你检查一下数据预处理部分怎么产生的NA PS：我们社区没有这样的视频，谢谢
回答于 2018-11-21 09:49
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RMAExpress处理cel原始数据
cdf和cel不匹配问题主要在于你的cdf没有找正确，你再仔细找找这个平台还有没有其他的cdf文件 自己把matrix.txt文件的表达量直接取2^化获得原来的非log转化表达量：这个是可以的
回答于 2018-11-21 09:36
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一键式wgna运行测试数据显示运行成功，但并无结果，程序右下角界...
将命令： "C:\Program Files\R\R-3.5.0\bin\Rscript.exe" "C:\Users\asus\Desktop\Sanger_V1.0.8\source\softs\5bece5eb9fdd8\WGCNA_Pipline.R" "C:\Users\asus\Desktop" "success_ExpData.txt" "success_Sam_info.txt" "1.2" "30" "unsigned" "5000" "0.25" "0.9" "2" "0.02" "-1" "1" 使用CMD再运行一下，看看有什么提...
回答于 2018-11-21 09:34