祝让飞
祝让飞 - 生物信息工程师 生信一期

性别: 浙江 - 杭州 注册于 2017-03-25

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1139 个回答

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请教,从GEO 下载的原始数据中有“///” 是什么意思?如图.还有请...

这是 一个探针对应多个基因的情况,可以直接删除

回答于 2018-10-09 10:52

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GEO便捷转换器错误Index:5,Size:5

这是一个bug,新版版已修正,你可以关闭盒子,重新打开一下便能再次使用了

回答于 2018-10-09 10:49

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生信盒子生存分析作图的实线和虚线分别代表什么?

实线代表生存曲线,虚线代表95%置信区间

回答于 2018-09-30 16:37

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简易下载工具V8无法下载数据

老版本的不行了,使用最新版的,再sanggerbox中,下载地址:http://sangerbox.com

回答于 2018-09-30 16:35

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老师,想问下怎么将RNA-seq中的ensemble ID转化成基因名字啊?搞...

便捷ID转换器可以帮你转化,你去看看

回答于 2018-09-18 10:47

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不同方式下载的TCGA数据出入较大

数值出入较大 你肯定是哪里下载错了,随访信息可能会有差别,转录组的 基本上不会有差异的

回答于 2018-09-18 10:43

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如何从OMIM数据库下载disease和gene关系

OMIM的这个数据需要申请的,你需要注册,申请数据,然后才给下载链接

回答于 2018-09-15 07:37

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RNA-Seq数据进行ID转化,许多基因转不出来,用以前的版本是可以...

是版本问题,没有转换出来的Symbol是因为目前这个Symbol还没有统一,在不同的数据库中名称不一样,所以 为了统一识别 工具对该类型的ENSG保留原貌,以便能寻根。

回答于 2018-09-15 07:36

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选择原文一样的条件,做不出DEG

你的这个截图可以看出 人家是用的配对 T检验,如果你和他用的是同一套数据的话,可能使用limma就筛不出来,大概率问题在于foldchange普遍比较小,你试试 使用1.5倍,或者1.3倍筛选

回答于 2018-09-13 19:59

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老师请问,TCGA中食管癌数据食管鳞癌代码是什么,腺癌是什么,谢...

食管癌 腺癌和鳞癌 好像不分,你下载临床随访信息 从发病部位看一下 哪些是鳞癌或腺癌

回答于 2018-09-13 16:30