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从TCGA下载的MicRNA数据第一列代表gene sympol吗？

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5 如何下载有circle rna 的GEO芯片

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安装Python出错，环境赋予不了，请大神指点

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3 生存分析中log Rank=NA

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NCBI的SRA数据库一个study对用的有文献吗?如何找到对应的文献?

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请问一些物种kegg没有数据，是怎么做出Pathway的呢

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关于miRNA靶基因预测

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GEO甲基化芯片分析

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TCGA数据 与 GEO数据 可以整合在一起用批次处理吗

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火山图画出来中间那块是空白的，不应该是黑的吗？

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  • Pham 2018-05-24 06:20

批量生存分析工具分析出来差异很明显，KM曲线差异也很明显，但在spss中去做却没有差异，怎么解释？

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小鼠做GSEA分析。用的是GSEA软件。请问我表达数据有16000多个，但是小鼠的gmt只有14000多，老是报错，咋办啊？

1 回答

请问老师们，从TCGA官网上利用GDC tool下载结肠癌基因表达的counts数据，和使用R包-TCGAbiolinks下载，得到的样本数量不一致，请问是什么原因？有遇到这样的情况的吗？

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  • hcs 2021-05-18 22:28

GSEA分析中上传gct文件一直出现There were errors: ERROR(S) #:1 Parsing trouble java.lang.NumberFormatException:

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用简易TCGA下载工具得到的RNAseq数据要做什么转换

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下载了64位盒子，其它小工具都可以下载，GEO转化器总是下载失败？下载进展条明明都已经加载满了，最后弹出下载失败，请重试！请问这是什么原因？

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3 megahit 组装报错Cannot identify read library type，如何解决？

1 回答

请问Win7系统下如何安装使用TCGA2STAT-R 包？

3 回答

老师们好，用火山图绘制软件，数据导入后，点击绘图，可是软件没有反应，麻烦老师了，感谢。

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请问在TCGA数据库中的RNA-seq中下载的mRNA基因表达谱数据是芯片数据还是测序数据，谢谢

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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