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  • zb 2018-03-07 18:31

5 如何判断一个基因表达的高低

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3 ID转换时部分ENSG不转换为gene symbol

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gpl5175 注释文件没有gene symbol，怎么该怎么用

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用suvival包的survdiff()做生存分析的时候报错，提示只有一个组，麻烦大家帮忙

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3 老师你好！我想用tcga mRNA数据估算肿瘤微环境中细胞相对含量，比如通过CIBERSORT、MCPcounter等工具进行转换，输入矩阵用counts，FPKM还是TPM数据啊？

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10 TCGAbiolinks报错求助

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癌症驱动基因和癌症驱动突变有何区别和联系？乘客基因和乘客突变有何区别和联系？

2 回答

20 请教大神：进行生存分析时，部分病人未到随访终点出现复发死亡，部分随访时间到了未出现结果，怎么解决？

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运用DEcenter的DESeq2进行分析总是报错，求解答。

2 回答

用GEO芯片数据转换器，选择转换id的列没有Gene Symbol这个选项怎么将ID转成基因呢？

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3 关于DESeq2分析RNA-seq差异基因的代码

1 回答

这个平台提供的是这些ID，如何转成Gene Symbol呢？

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安装clusterProfiler包出现问题

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  • oscarwang 生信一期  星标用户 2018-04-27 14:39

survivalROC包做时间依赖性曲线时，3年，5年，10年的定义值的含义？（参数为predict.time）

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GEO 矩阵表达量为负值

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5 如何过滤掉表达丰度低的基因？比如原始表达值小于10，超过25%样本就把它剔除掉；老师能不能给个R语言代码，非常感谢！

2 回答
  • ZaCH 2017-11-01 22:38

5 请问怎么对GEO芯片重注释提取lncRNA

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  • JUN 2017-11-25 20:53

15 WGCNA，没有表型数据如何计算模块与样本的相关性

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请教GEO数据里面有负数，怎么处理？

1 回答

GEO芯片探针ID如何转换成gene symbol

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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