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  • ZaCH 2017-11-21 20:05

3 下载TCGA counts数据后用EdgeR做差异分析，后续如果计算lncRNA与mRNA表达的相关系数，是用哪种数据呢？

3 回答

15 TCGAbiolinks安装问题求助

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15 TCGA数据库分析某个基因在癌症和癌旁组织的表达差异

2 回答

请问谁有TCGA相关的参考文献吗?

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用DEG center 或者用R语言的limma包进行差异分析，将FDR设置为0.05，log2FC为1时，没有结果

2 回答

Error in goodSamplesGenes(datExpr, verbose = 3) : 没有"goodSamplesGenes"这个函数

1 回答

5 按照推文中下载了TCGA中突变的信息后续如何处理

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  • 祝让飞 生信一期  星标用户 2017-03-26 17:37

Rstudio软件打开口出现空白，什么都没有

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  • liu 2018-07-17 23:56

5 GEO数据库下载后没有gene symbol

1 回答

5 Affy平台原始数据预处理，MAS5.0

2 回答

3 请问这种RIP-seq的数据怎么分析？

2 回答

SangerBox里的工具不能打开

1 回答

5 如何用TCGA的数据，分析某一基因在癌和癌旁的表达差异

3 回答

3 TCGA的DNA甲基化数据27k 和450k是什么意思？

1 回答

5 WGCNA 我使用R包已经运行完软阈值，在进行共表达数据挖掘时，软件一直提示错误，求助

1 回答

GSEA输入数据是RNA-seq，应该是fpkm还是counts，需要做预处理吗

1 回答

10 验证已知俩互作蛋白，用酵母双杂，二缺长出来，四缺不长，情况如下图，用AH109酵母感受态，PGAD，PGBK质粒。

1 回答
  • ss 2017-05-04 00:39

15 寻求TCGA数据库查找基因的操作步骤

1 回答

3 synteny同线性和collinearity共线性的区别和联系，最好画图举例

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5 求直接单独运行R脚本，处理矩阵，对多个探针的取其平均表达量

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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