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  • SHI 2018-01-28 18:46

10 TCGA生存分析时合并临床数据有问题？

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  • zyy 2019-12-31 08:35

为什么GEO里的有些 Series Matrix File(s) 下下来的表达矩阵是空呢

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5 TCGA里面的下载的临床XML文件是怎么转临床数据文本的？

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3 机器学习如何构建模型

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  • qqqq 2018-07-11 11:25

各位大神，低甲基化和高甲基化应该看哪个指标啊，看logfc的符号还是看deltaβ的符号

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geo数据fc怎么算，下载后的fc是已经去过log2的么。deenter的结果是logfc还是log2fc

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5 TCGA中下载的转录组数据包含mRNA，该如何提取mRNA的数据呢？

3 回答

15 TCGAbiolinks安装问题求助

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  • 1874 2018-05-10 02:22

利用生信人工具下载TCGA肝癌数据有正常样本，但网站上TCGA数据库（https://portal.gdc.cancer.gov/）并没有看到正常样本的基因表达信息是怎么回事？

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请教各位一下LncRNA和mRNA共表达怎么做？，谢谢

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如何区分下载的TCGA数据是癌组织还是正常组织？

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10 DNA甲基化数据可以做哪些生信分析跟癌症进展相关的

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学习了大神的文章《TCGA CNV全攻略》，以下一段代码总是提示“unexpected numeric constant in "wget -c -r -np -nH -k -L --cut-dirs 6"”，我想我哪个地方出了错误，请赐教

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如何利用TCGA数据进行生存分析

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用DEG center 或者用R语言的limma包进行差异分析，将FDR设置为0.05，log2FC为1时，没有结果

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3 TCGA差异分析

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10 验证已知俩互作蛋白，用酵母双杂，二缺长出来，四缺不长，情况如下图，用AH109酵母感受态，PGAD，PGBK质粒。

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  • ZZZZ 2021-09-25 16:58

3 芯片batch评估，sample太多，ggrepel包画pca图，画不下，如何解决？

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TCGA GDC 进不去怎么办 ？ 换了几个浏览器也没用

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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