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  • ss 2017-05-04 00:39

15 寻求TCGA数据库查找基因的操作步骤

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TCGA GDC 进不去怎么办 ？ 换了几个浏览器也没用

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TPM和RPM文件如何进行基因差异性分析？

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10 关于DESeq和edge R做差异表达的一些疑问

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10 有生物学重复的ChIP-Seq数据处理

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GEO 数据 下载后格式不统一怎么办？

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  • xixi 2019-06-20 14:34

5 TPM数据可以使用DEcenter里的limma包进行分析吗

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15 TCGA数据库分析某个基因在癌症和癌旁组织的表达差异

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生信人工具盒子V8 32位无界版没有GEO芯片数据转换器

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差异表达分析结果与生存分析结果不一致

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GSEA输入数据是RNA-seq，应该是fpkm还是counts，需要做预处理吗

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多因素生存、回归分析结果的系数、公式在哪里？

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  • msf 2017-09-13 11:37

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5 按照推文中下载了TCGA中突变的信息后续如何处理

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使用火山图小工具绘制出图形之后如何根据图中的点找到对应的基因？

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  • ZaCH 2017-11-21 20:05

3 下载TCGA counts数据后用EdgeR做差异分析，后续如果计算lncRNA与mRNA表达的相关系数，是用哪种数据呢？

1 回答
  • xkw 2017-09-10 20:10

TCGA HT-Seq counts数据用limma包voom函数筛选差异基因时，TMM和quantile normalization都要使用吗？两个都用和只用quantile标准化有啥区别？

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3 synteny同线性和collinearity共线性的区别和联系，最好画图举例

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10 关于ENSG_ID转换成基因名称的问题。

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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