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6883
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analybio
2019-04-17 08:48
祝老师,您好?如何识别GEO数据库下载文件是什么类型?
GEO
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金鹏
2017-05-26 16:36
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请问下载的TCGA 甲基化数据如何表示某个基因的甲基化水平呀,是该基因所有位点Beta值的均值吗?
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6818
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吴平
2017-12-01 16:11
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请问如何利用TCGA下载的miRseq数据中read counts 和RPM 进行miRNA差异分析,如何归一化
TCGA
miRNA
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回答
6779
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无品墨客
2018-03-12 03:41
差异表达分析结果与生存分析结果不一致
6
回答
6766
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樊祥宇
2018-07-03 08:08
10
利用BRIG做基因组圈图,怎么不能显示基因组比对的信息?
blast+
BRIG
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6757
浏览
Lily
2017-08-19 22:45
老师,怎样在TCGA下载某个基因与某个肿瘤的临床病理相关性以及该基因在肿瘤中的表达情况?
TCGA
1
回答
6745
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放牛班の春天
2017-07-27 09:15
WGCNA数据输入问题思考
WGCNA
RPKM
共表达
0
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6726
浏览
zyy
2019-12-31 08:35
为什么GEO里的有些 Series Matrix File(s) 下下来的表达矩阵是空呢
GEO
Series Matrix File(s)
1
回答
6723
浏览
xkw
2017-09-10 20:10
TCGA HT-Seq counts数据用limma包voom函数筛选差异基因时,TMM和quantile normalization都要使用吗?两个都用和只用quantile标准化有啥区别?
1
回答
6694
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专业制杖
2019-07-06 23:36
5
GEO多芯片联合分析方法
GEO分析
GEO
1
回答
6648
浏览
1874
2018-05-10 02:22
利用生信人工具下载TCGA肝癌数据有正常样本,但网站上TCGA数据库(https://portal.gdc.cancer.gov/)并没有看到正常样本的基因表达信息是怎么回事?
1
回答
6639
浏览
任美玲
2018-07-13 10:55
3
用TCGA小工具下载mRNA-seq表达数据,需要做批量生存分析和WGCNA,我看范例文章内都是下的FPKM,但我下载了FPKM数据,后期我又要做表达差异,需要用(DEseq)edgeR语言分析,又需要count数据,难道我还要再下载一次count数据吗?可以直接用DEseq工具分析FPKM数据吗?
TCGA
DECenter
差异分析
1
回答
6609
浏览
XU YE
2017-12-12 09:40
10
TCGA RNA-seq FPKM为什么不能进行TPM转换
RNA-Seq
1
回答
6595
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FEBRIE
2018-09-10 15:29
R语言打开时出现unable to initialize the JIT
R
3
回答
6594
浏览
胡云平
2017-11-28 17:41
GEO2R分析 ID转换问题
2
回答
6586
浏览
Autumn
2017-11-05 10:04
TCGA下载工具的ENSG_ID转换和TCGA ID转换器的区别
TCGA ID转换器
TCGA
2
回答
6579
浏览
无品墨客
2018-01-27 04:11
关于logrank
1
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6547
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刘磊
2018-08-29 13:49
count数据如何转为FPKM数据
WGCNA
1
回答
6547
浏览
ludwig
2017-11-26 22:41
5
GEO数据下载后处理
GEO芯片数据转换器
GEO数据分析器
GEO数据库
1
回答
6501
浏览
Xiang Xiaonan
2017-10-09 23:34
使用火山图小工具绘制出图形之后如何根据图中的点找到对应的基因?
火山图绘制工具
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