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GEO甲基化芯片分析

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请问在TCGA数据库中的RNA-seq中下载的mRNA基因表达谱数据是芯片数据还是测序数据，谢谢

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怎样知道目的基因在研究组织中是高表达，还是低表达。

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祝老师您好，我用TCGA的FPKM数据用CIBERSORT进行分解然后分组，再用组标签做生存分析时，得到的P值很大，分不开。我不确定是CIBERSORT的去卷积效果不好还是聚类的效果不好，以你的经验CIBERSORT的去卷积结果好吗，能得到好的实验结果吗

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老师们好，用火山图绘制软件，数据导入后，点击绘图，可是软件没有反应，麻烦老师了，感谢。

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TCGA简易数据库转换的时候，是ENSG_ID最后一位要加上1再去biomart转换？如：ENSG00000111224.12转换为gene名的时候将ENSG00000111224.12变为ENSG00000111224.13才转换，只有这样才能得到工具转换出来的结果，为什么加上1呢？

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  • ltzg 2017-08-14 00:14

gwas QQ图所有的点都在预测线上方

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  • zuby 2019-12-12 18:47

limma包运行时提示没有DGEList函数

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关于TCGA中GBM数据的使用

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  • hcs 2021-05-18 22:28

GSEA分析中上传gct文件一直出现There were errors: ERROR(S) #:1 Parsing trouble java.lang.NumberFormatException:

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3 megahit 组装报错Cannot identify read library type，如何解决？

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怎样用DEGseq软件做出差异基因表达相关图？

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ENSG_ID全部带有小数 例：ENSG00000242268.2 是把小数点连同小数点后面的一起去掉就可以了吗？

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10 hisat2+stringtie+ballgown得出的结果出现两个相同基因的FPKM值，如何处理？

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使用RMAExpress导出的数据第一列是探针？如何获得基因表达量？

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sangerbox只显示启动完成，啥都不出现

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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