祝让飞的回答

祝让飞 - 生物信息工程师生信一期

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1139 个回答

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GEO很多数据都是经过分位数标准化的，如果只选择其中的部分样本的话需要从原始数据开始选择你需要的样本重新标准化后再合并

回答于 2018-12-10 17:49

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工具下载的数据来源于GDC,RNA-Seq基本是是一致的，临床信息可能会存在一些不同，你浏览的统计信息和最后下载的未必一致，你下载下来再对比看看

回答于 2018-12-10 17:48

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只需要整理成矩阵就好

回答于 2018-12-10 17:45

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可以使用limma试一试

回答于 2018-12-10 17:44

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啥ID,ENSG?

回答于 2018-12-10 17:43

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最小基因数设定的太高，没有满足条件的通路，当然没结果了

回答于 2018-12-10 17:41

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把序列文件的第一行删掉就好了

回答于 2018-12-10 17:40

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提取不了，circRNA只能重新测

回答于 2018-12-10 17:39

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可以的呢，先把基因的表达数据提出来，然后根据样本类型分组，用Excel都能做呢

回答于 2018-11-30 19:43

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先百度差异分析，找到做差异分析的软件或R 包，然后再去搜这些软件的引用文章不就有了吗

回答于 2018-11-30 19:41