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TCGA数据下载之后的处理问题

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10 firebrowse中TCGA数据下载文件名的意义？

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  • 000 2020-06-17 14:17

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15 请问有没有生物信息学的方法可以用于找已知基因的互作基因(蛋白)？

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存在这种批间差异该如何处理？

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3 使用silva123数据库 qiime 1.7.0分析，filter_alignment.py 的-e -g如何设置

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我想咨询一下关于TCGA上CNV数据一些问题。我找的是breast的样本，但是我想通过breast的癌症级别对样本进行分类。我用了tumor stage作为分类标准，目前下载的样本有120多个，分了十几个tumor stage，有的tumor stage里的样本数才两个，想着不同tumor stage之间有没有可以合并的。不知道我整体的做法是否正确，求大神们助攻，谢谢!

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5 GEO下载数据包括病毒感染肿瘤，非病毒感染肿瘤和正常三种数据，想知道做差异分析时如何分组？谢谢

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gene的命名

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用癌组织和癌旁组织找出来的差异基因能说明什么问题呢？能用于区分癌症病人和正常人吗？谢谢

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15 特定条件下的双序列的全局比对设计

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大家好 新手一枚 请多关照哈

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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