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GEO2R分析 ID转换问题

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R语言打开时出现unable to initialize the JIT

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对编码基因的表达矩阵（数据格式：FPKM）进行WGCNA,为什么灰色模块基因那么多，是什么原因造成的

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  • XL 2018-11-26 20:52

misc-RNA能算作lncRNA嘛？

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3 GEO芯片数据无法导出数据矩阵

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LncRNA如何GO分析？

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GEO 数据 下载后格式不统一怎么办？

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求一份TCGA简易下载工具或者下载链接

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TCGA简易下载工具 下载的clinical数据那一列是肿瘤的RFS数据呢？

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10 GEO数据基因注释（GPL17586）Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0 如何转换为gene symble

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5 GTEX与TCGA数据移除批次效应时，出现报错，请问这是什么原因导致的？

1 回答
  • Xl 2019-02-20 05:16

lncRNA的GO 和KEGG分析第一步是靶基因预测嘛？一般选择哪个数据库呀？

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  • LX 2018-06-06 00:16

3 芯片数据RMA数据标准化工具需要芯片平台的cdf格式文件

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3 急啊，从GEO下载的series_matrix文件，解压之后得到TXT，3.95G，怎么打开啊？

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批量生存分析做出来p值很小 但是下方的生存曲线却看不出差别

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用tcga的RNA seq数据进行预后分析应该用表达值还是z-score

1 回答

你好，在请教您一下，下载的基因表达谱数据数据里面怎么区分是mRNA跟lncRNA？可以有什么方法可以提取出里面的LncRNA吗？刚接触这个数据，很多不懂的，向您请教一下，谢谢了

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R语言N must be at least 2。做WGCNA。

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TCGA下载工具的ENSG_ID转换和TCGA ID转换器的区别

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5 TCGA的bam和vcf下载

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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