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小白鼠
2017-11-12 17:47
3
如何用GEO2R筛选差异表达基因
1
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伊七
2018-11-09 09:34
10
用Rstudio下载GEO数据,出现could not find function "getGEO"怎么办
1
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7705
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x131
2021-04-26 10:26
13
请问http://sangerbox.com/TcgaDown下载的数据是log化的,还是没有log化的?
SangerBox
TCGA
1
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7699
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lxy1921
2019-04-21 18:03
KNN法补充缺失值,duplicate row.names are not allowed
GEO
R
1
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7694
浏览
王晓明
2018-02-26 20:08
10
TCGA临床信息中的肿瘤转移信息怎么获得?
TCGA
1
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7683
浏览
zhurui
2018-06-15 07:00
15
TCGA基因表达(HTSeq-FPKM)的样本名称和临床资料(Clinical merge)的样本名称不一样,如何对应?
1
回答
7667
浏览
金鹏
2017-05-26 16:36
13
请问下载的TCGA 甲基化数据如何表示某个基因的甲基化水平呀,是该基因所有位点Beta值的均值吗?
3
回答
7659
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wangliyu
2018-12-10 23:52
无fast格式的探针文件(GPL18109)如何利用Seqmap序列比对工具 寻找转录本注释
重注释
1
回答
7641
浏览
wongsektaai
2017-12-05 21:42
RNASeq-count数据合并
RNA-Seq
2
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7634
浏览
生信分析流
生信一期
2018-09-17 08:56
10
count数据做差异分析的时候,利用盒子edgeR或者DESeq2方法进行分析。edgeR获取的差异基因(FC 1和FDR0.05)对比别人用R包直接编程的总少很多。
差异分析
2
回答
7632
浏览
王小喵
2018-06-28 20:31
sangerbox工具窗口无法弹出
SangerBox
配置
1
回答
7630
浏览
xkw
2017-08-24 01:01
5
如何对多个GEO芯片进行标准化等预处理?
GEO
GEO数据库
芯片数据分析
2
回答
7612
浏览
张琦
2017-06-08 11:38
TCGA数据下载之后的处理问题
TCGA
3
回答
7610
浏览
UWI
2018-07-09 15:52
请问老师,我的基因ID转化后从MIMAT开头的变成了has-mir开头的,是转换成功了吗,后面这个就是基因名吗?以及我的火山图做不出来,无论是用Tumor-vs-Nomal.edgeR_Dif.txt的文件还是转换后的文件都不行(如图),两个都是文本格式txt,不知道哪里出问题了,希望老师们帮我看下,真的很感谢啊!
TCGA
TCGA ID转换器
火山图绘制工具
1
回答
7609
浏览
赵敏
2018-03-15 14:24
5
lncRNA测序数据分析结果中都是以TCONS_XXXXX命名,怎样能够将名字转换成标准形式呢
1
回答
7607
浏览
qiangrenya
2018-08-04 20:16
用在线工具GEO2R对GSE数据的癌组织和配对癌旁组织进行差异基因分析时,进行的配对检验还是2独立样本检验?
差异基因配对
0
回答
7602
浏览
陈晨
2022-09-15 15:26
大家好啊,世界您好啊,请多关照哈
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回答
7599
浏览
Dragon
2018-09-04 22:49
SangerBox下载TCGA转录本数据合并后癌症和癌旁组织区分
TCGA
2
回答
7593
浏览
无品墨客
2018-01-07 23:58
关于days to last followup问题
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回答
7587
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Shuyi Chen
2023-05-15 10:28
5
请问Lasso分析中risk score 为负值代表什么?
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