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求一份TCGA简易下载工具或者下载链接

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tcga基因表达量相关性

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3 请问差异分析里面的logFc的底数是多少呢，导出来的结果没有底数，是默认为2还是10？

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无fast格式的探针文件（GPL18109）如何利用Seqmap序列比对工具 寻找转录本注释

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gdc-client 在linux上运行失败，请问是什么原因？

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为什么GEO数据库用DECenter做差异分析出来的结果和别人实验验证的结果相反呢？分析出来是下调基因，而别人验证是上调基因。

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软阈值自动算出是1，但R2是负数。

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  • UWI 2018-07-09 15:52

请问老师，我的基因ID转化后从MIMAT开头的变成了has-mir开头的，是转换成功了吗，后面这个就是基因名吗？以及我的火山图做不出来，无论是用Tumor-vs-Nomal.edgeR_Dif.txt的文件还是转换后的文件都不行（如图），两个都是文本格式txt，不知道哪里出问题了，希望老师们帮我看下，真的很感谢啊！

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WGCNA gsg <- goodSamplesGenes(datExpr0)提示需要数值型数据

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5 GSEA

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你好，在请教您一下，下载的基因表达谱数据数据里面怎么区分是mRNA跟lncRNA？可以有什么方法可以提取出里面的LncRNA吗？刚接触这个数据，很多不懂的，向您请教一下，谢谢了

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GSEA富集分析出现一下Parsing trouble java.lang.IllegalStateException: ...报错，导入数据哪里出了问题呢？谢谢大牛们了。

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如何利用TCGA的miRNA profiling中的read_count求RPKM？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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