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启动子区域的 CpG 位点的筛选

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  • xkw 2017-09-05 20:16

如何处理TCGA count矩阵中重复的基因名

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  • XL 2018-12-14 11:53

ROC曲线下面积AUC值怎么比较？？

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为什么GEO数据库用DECenter做差异分析出来的结果和别人实验验证的结果相反呢？分析出来是下调基因，而别人验证是上调基因。

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如何从TCGA数据库下载下来的肿瘤组织表达基因筛选自己的目的基因表达/

1 回答

10 各位大神，我分析TCGA数据，某基因mRNA表达在肿瘤转移组低表达，非转移组高表达。 转移组患者生存时间短。但某基因和患者生存无关，这个如何解释？

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3 请问差异分析里面的logFc的底数是多少呢，导出来的结果没有底数，是默认为2还是10？

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GEO数据库有lncRNA的数据吗?怎么输入关键词检索

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5 如何下载TCGA完整的临床数据

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3 GEO芯片数据转换报错，芯片数据中的探针编码如何转换为gene信息？

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3 wgcna如何选软阈值

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Python处理如何将相同基因的FPKM算一个平均值再输出

2 回答

3 批量生存分析结果P值与图片中的Logrank 值不一致？

1 回答

RNA-Seq测序结果怎么进行分析？

1 回答
  • ZaCH 2017-11-23 20:16

关于TCGA数据filtration的问题

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  • xkw 2017-08-25 20:31

5 如何limma包将矩阵中的Probe_Id转换成Gene symbol呢？这个芯片的注释文件bioconductor没有，我下载的GEO中GPL的注释文件。

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DECenter运行出错，提示 some vale in assay are not integers，不是整数？该怎么解决？感谢老师们。

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你好，用TCGA的乳腺癌临床数据做生存分析时，1.用A1_OS，A2_Event 和vital_status，days_to_last_followup这两种都可以吗？2.数据用FPKM格式还是TPM格式

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10 GEO探针ID转换成gene symbol

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  • ZZZZ 2021-01-17 17:33

5 R中数据连续变量如何转换为分类变量？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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