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  • XL 2018-12-14 11:53

ROC曲线下面积AUC值怎么比较？？

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启动子区域的 CpG 位点的筛选

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5 如何下载TCGA完整的临床数据

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3 DEcenter报错，代码如下，附上分析的数据文件

3 回答

Python处理如何将相同基因的FPKM算一个平均值再输出

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  • lixj 2020-06-19 19:01

5 WGCNA筛选了方差前50%的基因，灰色模块还是很多是什么原因？

1 回答

10 各位大神，我分析TCGA数据，某基因mRNA表达在肿瘤转移组低表达，非转移组高表达。 转移组患者生存时间短。但某基因和患者生存无关，这个如何解释？

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  • xkw 2017-08-25 20:31

5 如何limma包将矩阵中的Probe_Id转换成Gene symbol呢？这个芯片的注释文件bioconductor没有，我下载的GEO中GPL的注释文件。

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3 请问差异分析里面的logFc的底数是多少呢，导出来的结果没有底数，是默认为2还是10？

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  • xkw 2017-09-05 20:16

如何处理TCGA count矩阵中重复的基因名

1 回答

RNA-Seq测序结果怎么进行分析？

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3 WGCNA软阈值过低

1 回答
  • ZaCH 2017-11-23 20:16

关于TCGA数据filtration的问题

1 回答

你好，用TCGA的乳腺癌临床数据做生存分析时，1.用A1_OS，A2_Event 和vital_status，days_to_last_followup这两种都可以吗？2.数据用FPKM格式还是TPM格式

1 回答

DECenter运行出错，提示 some vale in assay are not integers，不是整数？该怎么解决？感谢老师们。

3 回答

3 GEO芯片数据转换报错，芯片数据中的探针编码如何转换为gene信息？

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3 批量生存分析结果P值与图片中的Logrank 值不一致？

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10 GEO探针ID转换成gene symbol

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3 wgcna如何选软阈值

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Swiss model使用方法和结果分析

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