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学习了您之前关于芯片重注释的文章，用seqmap对RNA芯片进行了重注释，但文献里一般会用好几个数据库对同一张芯片进行重注释，如何处理这几个数据库的注释结果的关系呢，以一个数据库的结果为主，其他未能在这个主要数据库里注释上的探针再去别的数据库进行注释吗，还是几个数据库都同时进行注释，最后的结果再用某种方式进行取舍？还有多个探针对应同一个转录本时，这个转录本的表达水平怎么处理呢，是择其一，还是用这几个探针的表达水平的平均值？

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DECenter差异分析结果出现NaN是什么原因以及如何解决，谢谢

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GSEA运行报错

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转录组数据清洗或过滤

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老师好，请教下如何将从TCGA简易下载工具下载下来的转录数据中提取出lncRNA，谢谢

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请问各路大神，KDA分析（key driver analysis）用R语言，加载包在哪里？我在CRAN和bioconductor都没有找到。

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  • liyu 2019-03-03 11:28

生信盒子的相关系数计算有误

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无法启动Sangerbox里面的软件

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tcga简易下载工具之前的版本可以下载转移，现在的v14还可以吗？

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5 、前期转录谱研究发现，在病原侵染后，拟南芥A基因表达大量上调，请设计实验，研究A基因对该病原的响应机制 （不受实验条件限制）。

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芯片数据注释后有很多重复的该怎么处理？后续要做WGCNA什么的。

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circBANK是不是只可以用于人的标本分析， 不能用于小鼠的？如果没有有没有小鼠的circRNA数据库可以用的呢？

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  • LYL 2019-04-05 01:58

不同癌症表达差异太大

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5 rmats做可变剪接分析，输入b1.txt和b2.txt的时候，显示无法打开bam文件

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老师好，请教下如何将从TCGA简易下载工具下载下来的转录数据中提取出lncRNA，谢谢

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您好，我下载了sanger box后，点击那些小工具为什么没有出现这些小工具的页面？

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  • lei 2019-09-28 17:52

请问我用TCGA下载的数据进行sanger box工具里的GESA分析，点了批量运行后保存文件没反应，请问你是怎么解决的？谢谢！

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老师您好，能指导我这个问题吗？

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affix基因芯片没给差异基因的P值，怎么做火山图啊

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为什么sangerbox下载不到TCGA的数据

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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