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  • LYL 2020-06-21 16:15

GEO芯片数据转换器表达矩阵为0

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GSEA简易分析工具无响应

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祝老师 您好 我想请问为什么我在TCGA上下载的转录组数据合并之后打开tag那一行全都是MMRF_2106-null MMRF_2122-null MMRF_1593-null 这一种 这种类型的我无法判断是肿瘤还是正常组织？请问 是我哪里出错了吗 期待您的解答 谢谢

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3 便捷ID转换V3的lncRNA的注释文件还是genecode v22版本吗

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3 请问从http://sangerbox.com/TcgaDown下载的counts数据中，其中tags的命名含有rep这个问题。

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学习了您之前关于芯片重注释的文章，用seqmap对RNA芯片进行了重注释，但文献里一般会用好几个数据库对同一张芯片进行重注释，如何处理这几个数据库的注释结果的关系呢，以一个数据库的结果为主，其他未能在这个主要数据库里注释上的探针再去别的数据库进行注释吗，还是几个数据库都同时进行注释，最后的结果再用某种方式进行取舍？还有多个探针对应同一个转录本时，这个转录本的表达水平怎么处理呢，是择其一，还是用这几个探针的表达水平的平均值？

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  • JUN 2018-01-04 15:42

想请问有没有人知道这个是怎么做的?

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20 GEO数据集中组织样本的表达矩阵可以和细胞表达矩阵合并吗？

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ID便捷转换工具V3不能完全转换是什么原因？感谢！

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5 基因注释工具报错：Comparison method violates its general contract.

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  • zty 2020-08-25 07:21

老师您好，通过v16下载miRNA Profiling ISOFORM，合并后得到两个文件如下图，count之外的文件是FPKM数据吗？

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批量生存分析没跑就提示已经加载完成，是怎么回事“？

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无法启动Sangerbox里面的软件

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已经按照教程设置了java和R，但是点击“工具”中的内容无响应

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  • MIAO 2018-11-03 13:52

请问可用于WGCNA的材料处理

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DECenter差异分析结果出现NaN是什么原因以及如何解决，谢谢

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GSEA运行报错

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18 有参转录组定量工具提示路径无效

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请问各路大神，KDA分析（key driver analysis）用R语言，加载包在哪里？我在CRAN和bioconductor都没有找到。

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10 转录组一致性检验怎么搞？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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