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  • LYL 2020-06-21 16:15

GEO芯片数据转换器表达矩阵为0

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10 做了一次mRNA-seq和一次lncRNA-seq（不同时间段做的），共有3组（空白，模型，药理），发现两次结果的差异基因数差别很大（仅统计mRNA数据），即（mRNA-seq测得的模型和给药组的差异基因数50个，而lncRNA-seq测得的差异基因数为1000），请问下一步应该怎么办，不知道哪次的结果是正确的，困扰了我大半年了，希望好心人帮助我解决这个难题，不然没法毕业了

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  • ZaCH 2017-12-24 14:45

求助一个ArrayExpress的芯片处理

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怎么将合并的临床数据txt文本转换成excel表格呀？有脚本吗？

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一键式WGCNA，WGCNA的简易便捷分析软件

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分析数据时，相同的基因或者探针需要删除吗？

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TCGA下载工具

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不同方式下载的TCGA数据出入较大

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cuffdiff产生的转录本表达矩阵转成基因表达矩阵，能否直接用插件Trans Value Sum

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如何用TCGA下载小工具merge以后得到RPKM而不是counts的合并数据？

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V9版本生信下载工具TCGA数据下载中断了怎么办

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祝老师 您好 我想请问为什么我在TCGA上下载的转录组数据合并之后打开tag那一行全都是MMRF_2106-null MMRF_2122-null MMRF_1593-null 这一种 这种类型的我无法判断是肿瘤还是正常组织？请问 是我哪里出错了吗 期待您的解答 谢谢

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请问我从UCSCXena下载的这份TCGA RNA seq表达谱数据是FPKM数据吗，要做基因差异分析应该使用选择什么方法（limma？DESeq2？），谢谢！

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TCGA数据库是不是最全的？

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已经按照教程设置了java和R，但是点击“工具”中的内容无响应

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同一个人有两个miRNA的表达数据

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  • 杨 2019-08-18 09:29

请问如何在NCBI中下载某一物种转录组注释文件（gtf格式的）

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您好 ，我用贵平台的简易TCGA下载工具下载TCGA-ESCA(Esophageal Carcinoma-Esophagus)数据进行转录组分析，比对后样本数与文章报道的数目不一致

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  • Pham 2018-05-19 02:39

关于批量生存工具的一些改进建议

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  • zty 2020-08-25 07:21

老师您好，通过v16下载miRNA Profiling ISOFORM，合并后得到两个文件如下图，count之外的文件是FPKM数据吗？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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