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5 求问：SCDE包分析单细胞测序基因差异，使用手册中的命令不能重复出来是怎么回事

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igv可以看出input和实验组有明显区别情况下macs2callpeaks没有峰

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关于exon expression的问题

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TCGA简易下载工具合并文件问题

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请问如何分析TCGA中基因的表达量与临床数据的相关性

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  • 慧源 生信一期 2018-04-18 16:18

lncRNA一般表达量低于多少时可以认为不表达？

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3 请问样品相关系数用的基因原始数据，是否要取log2

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TCGA=matrix(as.numeric(as.matrix(GeneExp)),nrow=nrow(GeneExp),dimnames=list(rownames(GeneExp),colnames(GeneExp))) > TCGA=averegs(TCGA) Error in averegs(TCGA) : 没有"averegs"这个函数 >

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3 如何把基因ID批量转换为gene semble？

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5 miRNA数据合并后有两个文件：miRNA Profiling.isoform.merge.count.txt和miRNA Profiling.isoform.merge.txt，如何选择使用呢？

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为什么批量算生存和SPSS算生存差别比较大，但生存图看起来相似?

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  • LZH 2018-10-11 11:54

10 请问 我下载了TCGA数据，如何对某个特定基因进行分析呢（比如P53）

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10 GEO便捷转换器转换GEO数据后再行预后分析出错

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3 您好，请问怎么做predictor score！

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10 TCGA临床病理资料的提取

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miRNA数据集标准化

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DECenter

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转录组数据如何进行分析前的初处理

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  • 醒 生信一期 2018-06-17 16:10

平台注释文件里没有gene symble 怎么做GSEA分析？？导入GSEA里显示运行失败！！

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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