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WGCNA GUI文件读取问题

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3 SangerBox里面的WGCNA小工具，为什么我导入后得到的结果里面，表型总是“Random1”和“Random2”，样本信息里的表型根本就没有出现？

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  • 醒 生信一期 2018-06-17 16:10

平台注释文件里没有gene symble 怎么做GSEA分析？？导入GSEA里显示运行失败！！

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请问在线版的sangerbox里现在TCGA数据时只有肿瘤组织没有癌旁组织吗？

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miRNA数据集标准化

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DECenter

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  • DoL 2020-06-30 22:13

seqmap序列比对工具 求软件

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3 如何把基因ID批量转换为gene semble？

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3 为什么我用用生信人box里的插件一步一步分析的数据会没有差异基因，而用GEO2R则能得到很多差异基因？

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3 您好，请问怎么做predictor score！

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WGCNA临床信息赋值

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请问我从UCSCXena下载的这份TCGA RNA seq表达谱数据是FPKM数据吗，要做基因差异分析应该使用选择什么方法（limma？DESeq2？），谢谢！

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为什么批量算生存和SPSS算生存差别比较大，但生存图看起来相似?

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  • ZaCH 2017-12-24 14:45

求助一个ArrayExpress的芯片处理

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转录组数据如何进行分析前的初处理

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TCGA下载工具

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祝老师，我走hisat2+featurecounts+DESeq2得到count矩阵，对ensemble ID进行symbol转换时，存在多个ID对应一个symbol的情况，请问count矩阵应该怎么合并基因count表达值，有代码可以参考吗？

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  • 杨 2019-08-18 09:29

请问如何在NCBI中下载某一物种转录组注释文件（gtf格式的）

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如何用TCGA下载小工具merge以后得到RPKM而不是counts的合并数据？

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一键式WGCNA，WGCNA的简易便捷分析软件

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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