1 回答

GSEA输入数据是RNA-seq，应该是fpkm还是counts，需要做预处理吗

2 回答
  • ZaCH 2017-11-21 20:05

3 下载TCGA counts数据后用EdgeR做差异分析，后续如果计算lncRNA与mRNA表达的相关系数，是用哪种数据呢？

2 回答

10 关于ENSG_ID转换成基因名称的问题。

1 回答

WGCNA数据输入问题思考

1 回答

5 如何用TCGA的数据，分析某一基因在癌和癌旁的表达差异

0 回答

生存分析时候TCGA-SKCM(N=444) 和 TCGA-SKCM-M(N=347)有什么区别

1 回答

LncRNA如何GO分析？

2 回答

5 人和鼠的基因比较

4 回答

3 急啊，从GEO下载的series_matrix文件，解压之后得到TXT，3.95G，怎么打开啊？

1 回答
  • Xl 2019-02-20 05:16

lncRNA的GO 和KEGG分析第一步是靶基因预测嘛？一般选择哪个数据库呀？

2 回答

10 count数据做差异分析的时候，利用盒子edgeR或者DESeq2方法进行分析。edgeR获取的差异基因（FC 1和FDR0.05）对比别人用R包直接编程的总少很多。

1 回答

count数据如何转为FPKM数据

1 回答

WGCNA的问题，我做的关联性不强，请问这种情况常见吗？怎么改进呢

1 回答

5 sangerbox转化的TPM，表达值之间感觉差距很大，可以直接用于差异分析和heatmap.2热图绘制吗

1 回答

软阈值自动算出是1，但R2是负数。

1 回答

5 TCGA数据移除批次效应

1 回答

RNA-Seq测序结果怎么进行分析？

1 回答
  • ZaCH 2017-11-23 20:16

关于TCGA数据filtration的问题

3 回答

3 GEO芯片数据转换报错，芯片数据中的探针编码如何转换为gene信息？

1 回答

3 WGCNA软阈值过低

今天，你的分析遇到什么问题呢？

立即提问

热议话题 »

活跃用户 »

  1. 祝让飞 15620 经验
  2. strings 1100 经验
  3. 欢乐豆 910 经验
  4. 张海伦 1010 经验
  5. disciplinant 1450 经验
  6. TwoBeNO.1 350 经验
  7. 王诗翔 450 经验
  8. liuzhe 420 经验