• 夜神月 2017-10-11 14:54

TCGA简易下载工具snp somatic的问题

• TCGA

• 夜神月 2017-07-15 18:51

小工具下载的HT-counts可以直接用deseq包分析吗

• TCGA
• TCGA简易下载工具

• phonecy 2018-09-17 21:32

3 不同方式下载的TCGA数据出入较大

• 数据下载

• 夜神月 2017-07-29 23:33

各位老师，转换ID前的ENSG有6万多，转换后mRNA2万多，lnc一万多，那其他的是什么？

• TCGA简易下载工具

• 阿旺 2018-10-25 22:22

3 乳腺癌RNA-seq差异基因分析需要先排除基线（如年龄等）的影响吗？如果需要怎样找到癌旁组织的临床基本信息？谢谢

• TCGA
• 差异分析

• dukepck 2020-09-22 22:52

TCGA下载的RNA-seq数据（TXT），如何根据JSON患者数据合并

• TCGA

• anchor 2018-08-03 23:46

DE center里运行DESeq2做分析的时候，提示“不存在叫'DESeq2'这个名字的程辑包”，但是我系统自带的R软件已经安装了DESeq的包了，怎么解决？

• DEGseq

• qifengle 2019-04-15 20:48

8 SCDE包分析单细胞测序基因差异，使用手册中的命令不能重复出来是怎么回事

• 彭彭嘻嘻 2018-07-12 00:38

下载了几个GEO的数据集，都无法筛选出P小于0.05的差异基因，可把条件改成P小于0.1么？

• GEO
• GEO分析
• GEO数据库

• XiaoShi 2020-07-29 12:39

10 TCGA 成熟体miRNA数据（isoform）为什么同一肿瘤内的不同样本的miRNA数目不一样

• TCGA miRNA isoform

• wangqignshui 2017-10-04 09:01

3 样本过多内存不够，我把下载的文件分成2个文件夹放，单独合并，但是无法合并，不知道如何解决？

• TCGA

• Alvin 2017-04-14 10:11

NCBI SRA格式的文件转换问题

• SRA

• Shannon 2021-03-05 18:26

10 RNA-seq 差异表达 无重复样本

• 卢东 2019-10-08 17:27

SRA BLAST有用吗？

• SRA
• 转录组
• 蛋白质组

• 贺红娟 2018-05-01 19:43

DEcenter做Lnc差异表达遇到的问题:样本分组不能为第一列?

• 夜神月 2017-09-09 13:55

关于clusterprofiler包的问题

• Huang Kai 2017-10-27 00:14

有参转录组软件求助

• 转录组定量工具

• 任美玲 2018-07-18 15:43

3 做WGCNA只需要肿瘤的表达数据和临床数据，而不需要癌旁的基因表达数据吗？

• WGCNA

• 黄东兰 生信一期  星标用户 2018-07-24 22:51

将miRNA原始数据经过quantiles归一并用cluster软件滤过处理后的数据做出的箱线图看到很多小圆点，具体如下图，是否提示数据离散值多？直接进行差异分析可以？

• miRNA

• 陈柯 2017-07-01 19:44

利用TCGA资源，求助：从获取的差异基因集中，找出和预后相关的基因集，并根据统计学学参数依次排序，有知道如何用R实现吗？