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夜神月
2017-10-11 14:54
TCGA简易下载工具snp somatic的问题
TCGA
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phonecy
2018-09-17 21:32
3
不同方式下载的TCGA数据出入较大
数据下载
1
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3681
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夜神月
2017-07-15 18:51
小工具下载的HT-counts可以直接用deseq包分析吗
TCGA
TCGA简易下载工具
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3643
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dukepck
2020-09-22 22:52
TCGA下载的RNA-seq数据(TXT),如何根据JSON患者数据合并
TCGA
1
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3639
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夜神月
2017-07-29 23:33
各位老师,转换ID前的ENSG有6万多,转换后mRNA2万多,lnc一万多,那其他的是什么?
TCGA简易下载工具
1
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3630
浏览
XiaoShi
2020-07-29 12:39
10
TCGA 成熟体miRNA数据(isoform)为什么同一肿瘤内的不同样本的miRNA数目不一样
TCGA miRNA isoform
0
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3626
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qifengle
2019-04-15 20:48
8
SCDE包分析单细胞测序基因差异,使用手册中的命令不能重复出来是怎么回事
1
回答
3621
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阿旺
2018-10-25 22:22
3
乳腺癌RNA-seq差异基因分析需要先排除基线(如年龄等)的影响吗?如果需要怎样找到癌旁组织的临床基本信息?谢谢
TCGA
差异分析
1
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3621
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彭彭嘻嘻
2018-07-12 00:38
下载了几个GEO的数据集,都无法筛选出P小于0.05的差异基因,可把条件改成P小于0.1么?
GEO
GEO分析
GEO数据库
1
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3615
浏览
anchor
2018-08-03 23:46
DE center里运行DESeq2做分析的时候,提示“不存在叫'DESeq2'这个名字的程辑包”,但是我系统自带的R软件已经安装了DESeq的包了,怎么解决?
DEGseq
1
回答
3562
浏览
wangqignshui
2017-10-04 09:01
3
样本过多内存不够,我把下载的文件分成2个文件夹放,单独合并,但是无法合并,不知道如何解决?
TCGA
1
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3556
浏览
Alvin
2017-04-14 10:11
NCBI SRA格式的文件转换问题
SRA
0
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3544
浏览
卢东
2019-10-08 17:27
SRA BLAST有用吗?
SRA
转录组
蛋白质组
0
回答
3527
浏览
Shannon
2021-03-05 18:26
10
RNA-seq 差异表达 无重复样本
2
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3488
浏览
Huang Kai
2017-10-27 00:14
有参转录组软件求助
转录组定量工具
2
回答
3487
浏览
贺红娟
2018-05-01 19:43
DEcenter做Lnc差异表达遇到的问题:样本分组不能为第一列?
2
回答
3462
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黄东兰
生信一期
星标用户
2018-07-24 22:51
将miRNA原始数据经过quantiles归一并用cluster软件滤过处理后的数据做出的箱线图看到很多小圆点,具体如下图,是否提示数据离散值多?直接进行差异分析可以?
miRNA
1
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3460
浏览
夜神月
2017-09-09 13:55
关于clusterprofiler包的问题
1
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3438
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任美玲
2018-07-18 15:43
3
做WGCNA只需要肿瘤的表达数据和临床数据,而不需要癌旁的基因表达数据吗?
WGCNA
1
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3437
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捅刀斋
2018-06-27 10:50
以DECenter 输出的第三个文件做热图问题
DECenter
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