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3363
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LIYUE
2019-10-29 09:41
5
TCGA数据
tcga数据下载
1
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夜神月
2017-07-29 23:33
各位老师,转换ID前的ENSG有6万多,转换后mRNA2万多,lnc一万多,那其他的是什么?
TCGA简易下载工具
0
回答
3335
浏览
王生
2020-11-01 16:01
lncRNA重注释问题
lncRNA
GEO
重注释
1
回答
3319
浏览
阿旺
2018-10-25 22:22
3
乳腺癌RNA-seq差异基因分析需要先排除基线(如年龄等)的影响吗?如果需要怎样找到癌旁组织的临床基本信息?谢谢
TCGA
差异分析
1
回答
3309
浏览
anchor
2018-08-03 23:46
DE center里运行DESeq2做分析的时候,提示“不存在叫'DESeq2'这个名字的程辑包”,但是我系统自带的R软件已经安装了DESeq的包了,怎么解决?
DEGseq
3
回答
3307
浏览
phonecy
2018-09-17 21:32
3
不同方式下载的TCGA数据出入较大
数据下载
1
回答
3303
浏览
wangqignshui
2017-10-04 09:01
3
样本过多内存不够,我把下载的文件分成2个文件夹放,单独合并,但是无法合并,不知道如何解决?
TCGA
1
回答
3302
浏览
彭彭嘻嘻
2018-07-12 00:38
下载了几个GEO的数据集,都无法筛选出P小于0.05的差异基因,可把条件改成P小于0.1么?
GEO
GEO分析
GEO数据库
1
回答
3277
浏览
Alvin
2017-04-14 10:11
NCBI SRA格式的文件转换问题
SRA
0
回答
3271
浏览
qifengle
2019-04-15 20:48
8
SCDE包分析单细胞测序基因差异,使用手册中的命令不能重复出来是怎么回事
0
回答
3270
浏览
dukepck
2020-09-22 22:52
TCGA下载的RNA-seq数据(TXT),如何根据JSON患者数据合并
TCGA
1
回答
3200
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任美玲
2018-07-18 15:43
3
做WGCNA只需要肿瘤的表达数据和临床数据,而不需要癌旁的基因表达数据吗?
WGCNA
1
回答
3194
浏览
XiaoShi
2020-07-29 12:39
10
TCGA 成熟体miRNA数据(isoform)为什么同一肿瘤内的不同样本的miRNA数目不一样
TCGA miRNA isoform
0
回答
3193
浏览
Shannon
2021-03-05 18:26
10
RNA-seq 差异表达 无重复样本
1
回答
3188
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夜神月
2017-09-09 13:55
关于clusterprofiler包的问题
2
回答
3175
浏览
贺红娟
2018-05-01 19:43
DEcenter做Lnc差异表达遇到的问题:样本分组不能为第一列?
0
回答
3137
浏览
张桂红
2018-03-20 21:11
请问如何分析TCGA中基因的表达量与临床数据的相关性
1
回答
3120
浏览
Zeng Jing
2017-12-09 00:25
在使用DeCenter时,软件只运行到检验完成,但是后面的差异一直不动,
miRNA
1
回答
3118
浏览
陈柯
2017-07-01 19:44
利用TCGA资源,求助:从获取的差异基因集中,找出和预后相关的基因集,并根据统计学学参数依次排序,有知道如何用R实现吗?
0
回答
3103
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卢东
2019-10-08 17:27
SRA BLAST有用吗?
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比较基因组
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TCGA 中某个基因表达量怎么和临床信息对应起来
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