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TCGA数据，不同肿瘤的数据是否可以合并分析

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  • x131 2021-04-26 10:26

13 请问http://sangerbox.com/TcgaDown下载的数据是log化的，还是没有log化的？

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GEO数据库geo81089的Supplementary file有两个文件，哪个是原始counts数据，哪个是已经标准化（归一化）的数据？

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启动子区域的 CpG 位点的筛选

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GEO芯片数据转换器中转换ID怎么选择

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基因symbol注释GEO芯片时，如何把mRNA和lncRNA分别标注出来？

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自己下载的TCGA临床数据，一种是一个JSON文件，一种是很多个XML文件，怎么把它们转化成表格形式呢？

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5 geo数据库按series搜索的，同一疾病，study type限定为“Expression profiling by array”，然后结果有DNA芯片，有RNA芯片，这两个芯片各自的差异基因可以用来GO富集发文章吗

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3 生信人工具盒V7，GEO芯片数据转换器下载不了

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  • XL 2018-03-11 21:35

5 cox回归的分类变量结果怎么自动分组展示了？

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各位老师好，请问sangerbox里的TCGA简易下载工具里面下载数据后怎么进行ENSG-ID转换呢？

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20 GEO数据基因注释问题（GPL17586）Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0

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10 使用简易TCGA下载工具的若干问题！谢谢

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3 GEO芯片数据转换报错，芯片数据中的探针编码如何转换为gene信息？

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3 按照教程多个GEO数据集差异分析结果进行综合，RRA工具报错

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GSEA中FDR都是1的问题

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excel 转成TXT后数据列对不齐，导入火山图软件后画出来的图不准

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  • ZaCH 2017-11-10 20:28

3 请问TCGA下载工具V6整理的临床信息，怎么确定是否复发来计算DFS？

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GEO芯片数据中，从同一平台上下载几个不同芯片，这其中包含的多个cel文件可不可以直接放在同一文件夹内用R进行分析？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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