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3 我筛选出1000多个差异表达的lncRNA，做了批量生存分析之后，结果文件里只有400多个lncRNA了，这种情况正常吗？筛选的标准是什么？

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  • K28 2018-09-05 15:46

GDC client打开闪退求解释

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5 v8 版的ENSG转换，ENSG-ID编号都是有小数点的

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求教：多个不同内容的数据集进行整合分析

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高通量测序数据中，CpG甲基化谱的获取

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5 请问数据TCGA简易工具下载的miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling是否区分3p和5p序列？

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10 求助TCGA生存数据提取的perl脚本

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验证已互作蛋白，酵母双杂出现问题，二缺长出来，四缺不长，用AH109，PGADT7，PGBKT7。

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请问老师，这是Firehose上的截图，miRNA和miRNAseq,mRNA和mRNAseq的区别是什么呢

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  • wtj 2021-11-07 15:12

一键计算泛癌中基因表达与TMB、MSI、purity、ploidy、HRD、LOH、新抗原的关系 工具怎么购买

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分析GEO数据库GSE117830中lncRNA,但是分析出来ID没有见过，ASHG19A3A011733。。。这种怎么转换成ENSG啊？

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火山图和热图

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TCGA简易工具下下来的CNV数据中的segment_mean是和正常组织比对之后的gain/loss的倍数吗？能否直接拿来作图？

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3 GEO的RNA-Seq数据为RPM，如何转换为TPM?

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  • zero 2018-09-12 09:26

wgcna分析tcga的数据，好多基因表达为0，可以删除这些基因吗？怎么删除？谢谢！

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  • ayyz 2018-12-29 09:57

5 TCGA数据中的很多样本数据缺失，显示为NaN，在做热图或者计算相关系数时应该如何处理？是将该数据删除吗？

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哪里可以下载GEO芯片数据转换器？

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使用TCGA简易工具下载breast的solid tissue normal的CNV数据，里面分为grch38.seg.txt和nocnv_grch38.seg.txt，想问一下这两个格式的文件有什么区别？我想做一个不患乳腺癌的reference，需要用到什么文件呢？

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老师，我用DAVID和g:Profiler两个软件做GO富集分析结果不同，是做的不对，还是不同的软件结果就应该不同呢？

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  • XL 2018-11-19 09:36

用survivalROC包做ROC曲线出问题了

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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