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姝婧怡
2017-09-22 22:52
使用TCGA简易工具下载breast的solid tissue normal的CNV数据,里面分为grch38.seg.txt和nocnv_grch38.seg.txt,想问一下这两个格式的文件有什么区别?我想做一个不患乳腺癌的reference,需要用到什么文件呢?
TCGA下载
拷贝数变异
参考基因组
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尹立
2017-11-27 18:07
GEO芯片数据转换器中转换ID怎么选择
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周永杰
2019-11-05 18:05
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GEO数据基因注释问题(GPL17586)Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0
重注释
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神奇小萝卜
2019-01-13 21:32
3
请教一下WGCNA的软阈值问题
WGCNA
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zzp40
2018-06-23 17:21
各位老师好,请问sangerbox里的TCGA简易下载工具里面下载数据后怎么进行ENSG-ID转换呢?
SangerBox
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戴瑨
2017-12-11 17:00
10
TCGA简易工具下载数据视频教学版 能再发一次么
TCGA简易下载工具
1
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5499
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无名
2018-06-15 23:15
TCGA胶质瘤数据下载相对应的癌旁/正常对照
6
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陈思齐
2018-06-21 14:22
3
按照教程多个GEO数据集差异分析结果进行综合,RRA工具报错
GEO分析
0
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5481
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生信摸鱼家
2017-10-12 21:09
DEC运行出错b'ERROR : No residual degrees of freedom in linear model fits \r\n'求解答
DECenter
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5478
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Morning
2020-03-26 20:17
3
TCGAbiolinks安装求助
R
3
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5475
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李发科
2018-05-26 14:44
3
GEO芯片数据转换报错,芯片数据中的探针编码如何转换为gene信息?
GEO芯片数据转换器
报错
2
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5463
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天空的眼泪
2017-11-09 10:39
请问,通过TCGA简易工具下载的miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling(数据类型是芯片数据吗?)可以做miRNA差异表达分析吗?如果可以的话,用DECenter小工具时应选的方法是limma(芯片),还是edgR(counts数据)
DEC
DECenter
miRNA
1
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5463
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land_fly
2017-08-30 14:48
DNA甲基化疑问
DNA甲基化
CpG
1
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5461
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kingsire
2017-06-09 13:39
TCGA简易工具下下来的CNV数据中的segment_mean是和正常组织比对之后的gain/loss的倍数吗?能否直接拿来作图?
CNV
TCGA
TCGA下载
1
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5453
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theobagwell
2018-10-10 22:12
用简易工具v14下载TCGA的SNP数据该下载哪个?如VarScan2..., MuSE..., MuTect2...,还是SomaticSniper...?各是什么意思?
SNP
TCGA
2
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5452
浏览
努力追赶的老阿姨
2018-01-13 23:08
通路包括什么通路?GO. KEGG吗?作图的话cytoscape怎么做KEGG通路图?请教大神!
1
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5447
浏览
Dr_grass
2018-06-01 11:35
5
TCGA 甲基化数据大小问题
TCGA
1
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5445
浏览
000
2020-06-17 14:17
3
不同组织的样本可以分别筛选差异基因,然后再取交集进行后续分析吗?
GEO分析
GEO数据挖掘
交集
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回答
5443
浏览
大白(●—●)
2018-03-27 14:43
pheatmap美化
pheatmap
热图
1
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5441
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zbbland
2017-10-19 13:51
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使用简易TCGA下载工具的若干问题!谢谢
TCGA
TCGA简易下载工具
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