热门的问题 - 第16页

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无品墨客 2018-03-23 06:16

miRNA差异表达分析结果与生存分析不一致，数据能否发表

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huage 2017-11-28 09:58

3 找不到Arraystar Human LncRNA microarray V2.0 平台的注释文件

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Morning 2020-03-26 20:17

3 TCGAbiolinks安装求助

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land_fly 2018-02-08 20:17

TCGA临床信息——tobacco_smoking_history 中1,2,3,4,5 分别表示什么意思都是吸烟的吗？

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冯晓飞 2021-08-28 19:11

3 机器学习如何构建模型

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franknan 2018-06-25 10:34

3 我筛选出1000多个差异表达的lncRNA，做了批量生存分析之后，结果文件里只有400多个lncRNA了，这种情况正常吗？筛选的标准是什么？

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姝婧怡 2017-09-22 22:52

使用TCGA简易工具下载breast的solid tissue normal的CNV数据，里面分为grch38.seg.txt和nocnv_grch38.seg.txt，想问一下这两个格式的文件有什么区别？我想做一个不患乳腺癌的reference，需要用到什么文件呢？

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大白(●—●) 2018-03-27 14:43

pheatmap美化

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000 2020-06-17 14:17

3 不同组织的样本可以分别筛选差异基因，然后再取交集进行后续分析吗？

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戴瑨 2017-12-11 17:00

10 TCGA简易工具下载数据视频教学版能再发一次么

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喳喳 2017-05-02 16:37

3 请问有没有大神用过mVISTA?输入文件里边的注释文件怎么生成吖？

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任家成 2020-02-11 11:49

10 有人做过“ENST00000000233.9_1”这种ID的转录本注释吗？

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曾哲 2018-10-04 15:41

用一键式WGCNA出现datExpr must contain numeric data.

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徐博洋 2018-12-28 17:45

GEO数据标准化

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cbj625 2021-12-14 20:25

10 DNA甲基化数据可以做哪些生信分析跟癌症进展相关的

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卫鑫 2020-12-28 19:18

请问TCGA用lasso做预后模型，用GEO验证，结果验证组risk全是低风险组，是不是TCGA和GEO两个数据要先做处理，“统一”化？TCGA是从UCSC上下载的

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Nick 2017-06-07 13:37

3 vsearch如何下载安装和使用，与usearch在脚本中的用法是否有较大差异？

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无品墨客 2017-11-28 10:43

怎样快速简洁的从TCGA数据库中提取预后相关信息？

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LX 2018-07-22 22:56

用GEO2R和DECenter同时做一个数据库，结果相反，但是我完全是按照先加入肿瘤样本，再粘贴对照组样本，出来的确是反的，但差异因表达上调和下调与oncomine基本一致。而GEO2R的数据如下图，在肿瘤中明明低表达，癌旁中高表达，但logFC却是正值，是不是有问题，求解答

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Cabbage 2018-02-02 23:51

miRNA差异表达分析结果与生存分析不一致，数据能否发表

3 找不到Arraystar Human LncRNA microarray V2.0 平台的注释文件

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3 我筛选出1000多个差异表达的lncRNA，做了批量生存分析之后，结果文件里只有400多个lncRNA了，这种情况正常吗？筛选的标准是什么？

使用TCGA简易工具下载breast的solid tissue normal的CNV数据，里面分为grch38.seg.txt和nocnv_grch38.seg.txt，想问一下这两个格式的文件有什么区别？我想做一个不患乳腺癌的reference，需要用到什么文件呢？

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3 请问有没有大神用过mVISTA?输入文件里边的注释文件怎么生成吖？

10 有人做过“ENST00000000233.9_1”这种ID的转录本注释吗？

用一键式WGCNA出现datExpr must contain numeric data.

GEO数据标准化

10 DNA甲基化数据可以做哪些生信分析跟癌症进展相关的

请问TCGA用lasso做预后模型，用GEO验证，结果验证组risk全是低风险组，是不是TCGA和GEO两个数据要先做处理，“统一”化？TCGA是从UCSC上下载的

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怎样快速简洁的从TCGA数据库中提取预后相关信息？

关于TCGA生存分析FPKM数据处理的问题

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