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5 WGCNA,运行错误ERROR : Length of 'xLabels' must equal the number of columns in 'Matrix.' 大神出来帮个忙哈，赶着些毕业论文，多谢啦

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  • ZJT 2019-04-06 02:43

5 一键WGCNA运行出错

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为什么下载matrix找不到矩阵数据

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TCGA里面成对的癌和癌旁组织

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3 生信人工具盒V7，GEO芯片数据转换器下载不了

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用一键式WGCNA出现datExpr must contain numeric data.

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3 找不到Arraystar Human LncRNA microarray V2.0 平台的注释文件

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你好，用TCGA的乳腺癌临床数据做生存分析时，1.用A1_OS，A2_Event 和vital_status，days_to_last_followup这两种都可以吗？2.数据用FPKM格式还是TPM格式

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  • LX 2018-07-22 22:56

用GEO2R和DECenter同时做一个数据库，结果相反，但是我完全是按照先加入肿瘤样本，再粘贴对照组样本，出来的确是反的，但差异因表达上调和下调与oncomine基本一致。而GEO2R的数据如下图，在肿瘤中明明低表达，癌旁中高表达，但logFC却是正值，是不是有问题，求解答

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3 请问有没有大神用过mVISTA?输入文件里边的注释文件怎么生成吖？

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火山图和热图

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自己下载的TCGA临床数据，一种是一个JSON文件，一种是很多个XML文件，怎么把它们转化成表格形式呢？

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祝老师请教一个问题，火山图的横纵坐标虚线值是多少？

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3 我筛选出1000多个差异表达的lncRNA，做了批量生存分析之后，结果文件里只有400多个lncRNA了，这种情况正常吗？筛选的标准是什么？

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KNN法补充缺失值，duplicate row.names are not allowed

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  • K28 2018-09-05 15:46

GDC client打开闪退求解释

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WGCNA分析前的数据处理

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miRNA差异表达分析结果与生存分析不一致，数据能否发表

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老师，我用DAVID和g:Profiler两个软件做GO富集分析结果不同，是做的不对，还是不同的软件结果就应该不同呢？

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  • ZaCH 2017-11-10 20:28

3 请问TCGA下载工具V6整理的临床信息，怎么确定是否复发来计算DFS？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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