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请问，通过TCGA简易工具下载的miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling（数据类型是芯片数据吗？）可以做miRNA差异表达分析吗？如果可以的话，用DECenter小工具时应选的方法是limma(芯片），还是edgR（counts数据）

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请问有人会用starbase进行lncRNA和miRNA的比对吗？做ceRNA网络中用的，谢谢

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  • qqqq 2018-06-28 10:45

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祝老师，我走hisat2+featurecounts+DESeq2得到count矩阵，对ensemble ID进行symbol转换时，存在多个ID对应一个symbol的情况，请问count矩阵应该怎么合并基因count表达值，有代码可以参考吗？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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