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3 怎么解释UCSC Xena提供的临床信息？哪些是最重要的？

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用limma包做tcga数据差异分析，应该用下图中的哪个数据？是用标准化后的还是原始数据？如果做生存分析呢？

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15 TCGA临床信息中的grade分期如何获得？

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RNA-seq的GSEA

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请问老师们，软件里的批量生存分析用的是单变量COX回归分析吗？为什么我用批量生存分析软件计算得出与生存分析相关的基因，在多变量COX模型里得出P<0.05的基因，但是在做KM生存曲线的时候却显示生存没差异呢？

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SRA的数据可以像GEO一样差异分析吗？有相关的工具吗？

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存在这种批间差异该如何处理？

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10 GDC在win10上无法运行（已解决）

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  • mz 2018-04-27 19:54

tcga RNA-Seq数据为RPKM，不是FPKM，可以用RPKM算生存期，差异表达吗

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GSEA的分析一直报错，可以有gct和cls的文件出来，但是文件夹是空的，用两个版本盒子试过都不行。换成根目录文件夹也不行

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10 关于提取TCGA的maf文件中的基因突变信息

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3 使用silva123数据库 qiime 1.7.0分析，filter_alignment.py 的-e -g如何设置

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15 请问有没有生物信息学的方法可以用于找已知基因的互作基因(蛋白)？

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FPKM转换TPM后的分析方法

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TCGA临床数据提取后那些“938、854”这些数字（如图）代表什么意思？

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WGCNA分析， 基因表达文件中，有2万个基因，如何进行选取？是根据方差？还是选取差异表达的基因做WGCNA?

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请问老师，这是Firehose上的截图，miRNA和miRNAseq,mRNA和mRNAseq的区别是什么呢

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您好，GEO数据库下载下来的数据集怎么区分出mRNA跟lncRNA？有没有什么工具可以用？

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什么是adaptor sequences and quality trimmed reads ？

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  • ZZZZ 2021-01-17 17:33

5 R中数据连续变量如何转换为分类变量？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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