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5 请问利用TCGA的数据求两个基因的相关系数，应该用FPKM还是应该用TPM呢？

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3 生信人工具盒V7，GEO芯片数据转换器下载不了

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  • sean 2018-06-14 23:21

TCGA lunch data portal打不开

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  • SXR 2017-03-30 11:34

类似galaxy 一样的生信分析平台有哪些？

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sangerbox启动完成，但是一直弹不出工具窗口

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怎样快速简洁的从TCGA数据库中提取预后相关信息？

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  • SXR 2017-04-06 10:12

简易TCGA工具问题：请问这个合并文件怎么总报错呢

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10 tcga如何下载某一特定类型的肿瘤数据，譬如舌癌，口腔癌

1 回答
  • Nick 2017-06-07 13:37

3 vsearch如何下载安装和使用，与usearch在脚本中的用法是否有较大差异？

2 回答

TCGA数据，不同肿瘤的数据是否可以合并分析

1 回答

3 请问有没有大神用过mVISTA?输入文件里边的注释文件怎么生成吖？

2 回答
  • LX 2018-07-22 22:56

用GEO2R和DECenter同时做一个数据库，结果相反，但是我完全是按照先加入肿瘤样本，再粘贴对照组样本，出来的确是反的，但差异因表达上调和下调与oncomine基本一致。而GEO2R的数据如下图，在肿瘤中明明低表达，癌旁中高表达，但logFC却是正值，是不是有问题，求解答

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GEO芯片数据转换器中转换ID怎么选择

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如何使用生信人工具盒把差异基因里的lncRNA和mRNA分开

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3 使用R的clusterProfiler包无法正确匹配

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用一键式WGCNA出现datExpr must contain numeric data.

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5 TCGA 甲基化数据大小问题

1 回答
  • XL 2018-03-11 21:35

5 cox回归的分类变量结果怎么自动分组展示了？

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TCGA 下在某一癌型的甲基化数据（450K 平台），如何判断、筛选那些是启动子区域的甲基化位点哈……

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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