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新手在做WGCNA可视化TOM矩阵出现错误: 无法分配大小为2.3 Gb的矢量

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3 怎么解释UCSC Xena提供的临床信息？哪些是最重要的？

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  • 祝让飞 生信一期  星标用户 2017-03-29 10:26

3 illumina测序的reads的产量主要取决于什么？

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GEO数据库中的芯片数据txt文件（比如GSExxxx_series_matrix.txt）都是已经log化后的数据吗？

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请问老师们，软件里的批量生存分析用的是单变量COX回归分析吗？为什么我用批量生存分析软件计算得出与生存分析相关的基因，在多变量COX模型里得出P<0.05的基因，但是在做KM生存曲线的时候却显示生存没差异呢？

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TCGA生存分析

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  • JUN 2017-11-28 10:21

WGCNA：模块画出来都是一个颜色

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FPKM转换TPM后的分析方法

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  • mz 2018-04-27 19:54

tcga RNA-Seq数据为RPKM，不是FPKM，可以用RPKM算生存期，差异表达吗

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用limma包做tcga数据差异分析，应该用下图中的哪个数据？是用标准化后的还是原始数据？如果做生存分析呢？

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GSEA结果解读遇到问题，求解答，谢谢！

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关于TCGA下载工具lncRNA的count和fpkm

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5 WGCNA使用疑问

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SRA的数据可以像GEO一样差异分析吗？有相关的工具吗？

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10 使用GEO小工具的过程中，miniml无法下载

1 回答

请问下TCGA clinical数据里A8_New_Event_Time和A1_OS里的数据完全一样，A8的数据是不是错了？谢谢！

1 回答

您好，GEO数据库下载下来的数据集怎么区分出mRNA跟lncRNA？有没有什么工具可以用？

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  • tnt 2018-04-23 13:54

GSEA工具盒子报运行出错，得到gct和cls，无my_analysis.Gsea文件

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3 tobacco_smoking_history 1234

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最新DECenter差异分析limma包加载不了怎么解决？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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