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请教老师：我一共找到4个GSE数据集，分别以GSE1、GSE2、GSE3、GSE4代替，其中GSE1、GSE2、GSE3是同一个GPL，GSE4是另外一个GPL, 我该怎么分析？把GSE1、GSE2、GSE3提取原始数据，合成一个，然后与GSE4分别计算差异基因，二者取交集？谢谢

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TCGA小工具合并文件功能

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10 有人试过用PVCA 包分析批次效应吗？

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15 TCGA下载的乳腺癌临床数据中指标的具体解读

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GSE31046中GPL13996注释只有spot ID，而用这个ID在NCBI中找不到对应基因？

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8 有扩增子的详细视频教程吗？

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TCGA简易下载工具能不能下载临床数据？

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搞生信最简单的流程是什么呢？找差异基因，做GO KEGG PPI？有没有一条明确的套路呢？希望大神们指点指点，生信小白谢谢大家

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GEO数据分组

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DEC运行出错，请检查日志和数据，这是什么问题

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从公众号看到的:“ 简易TCGA下载工具-V8”这个软件，小编说在生信人社区上可以下载，怎么没有找到

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5 生信工具盒里面的批量生存分析工具，按照教程运行12个小时结果都没出来，请老师帮我看看，谢谢

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老师，我想自学生物信息学，想请教您生物信息学和统计遗传学有没有比较好的参考书呢？还有用R软件可以基本实现所有生物信息学的所有数据分析方法吗？还有可不可以用R软件代替plink呢[疑问]

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差异基因分析

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  • XL 2018-11-24 11:00

进行lncRNA重注释选择两数据库重叠基因，但基因名不同怎么办？

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  • jill 2019-03-30 23:59

TCGA ID转换后部分ID转换不了，转换导出是空白文档，请问这要怎么解决呢？转换导出是到merge.txt中还是另建新的txt文档呢？谢谢大佬！

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  • Dony 2019-01-07 15:15

unable to find an inherited method for function ‘probeNames’ for signature ‘"matrix"’

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5 GEO中GPL16956平台，没有genesymbol信息，只有ID和SOPT_ID，请问怎么处理可以得到genesymbol？

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R语言和GEO2R得到的差异基因差别很大，哪一个结果更准确一些

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在线功能富集分析工具除了DAVID网站外，还有哪个网站啊？

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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