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慕谷·多泰 数据挖掘训练营第二期 开讲啦！

不是所有培训都能值回票价的，更不是所有培训都赠送价值几千元的线上视频课程！！

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• 生信分析流 发布于 2018-08-06 10:51

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来自6分新贵杂志的生信数据分析

《柳叶刀》旗下杂志，居然也收生信分析文章..

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• 生信分析流 发布于 2018-07-31 10:15

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基因表达与甲基化关联分析，挖掘表观诱导的潜在肿瘤标志物（生信分析方案）

通过基因表达与甲基化的关联分析，筛选启动子区域甲基化修饰改变而引起 基因表达改变，从而对病人预后产生不良影响的基因。

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• 生信分析流 发布于 2018-07-27 14:46

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GEO和TCGA数据库挖掘文章思路！

TCGA、GEO、GSEA富集分析套路解析！

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• 组学生物 发布于 2018-07-19 08:48

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TCGA数据发表5分文章

5分TCGA文章的解读

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• 组学生物 发布于 2018-07-13 10:05

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文章解读：乳腺癌甲基化分型的TCGA公共数据挖掘文章思路解析

这是一篇发表在五分多的杂志上的纯生信的文章，思路清晰，数据获取简便，在其他的癌症的分析中可以套用。

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• 祝让飞 发布于 2018-05-01 15:04

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TCGA大作战——初步分析RNA-seq数据

下载、处理及初步分析TCGA level3的RNA-seq数据

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• 文虎 发布于 2017-12-24 15:51

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拿TCGA肝癌的RNA-Seq数据来做差异分析例子

刚写了一篇如何用GEO数据来做差异的例子如：https://www.shengxin.ren/article/207 这次来用TCGA的肝癌的数据来演示以下，我们选择大家比较喜欢的RNA-Seq Counts数据 使用TCGA简易下载工具选...

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• 祝让飞 发布于 2017-10-26 20:27

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TCGA RNASeq数据归一化工具说明

TCGA RNASeq数据提供了三种下载格式，很多新手不知道下载哪种格式的数据比较好，因为一些筛选差异的包比如（edgR等）需要Counts，所以很多人去下载了Counts，然后后续却不知道怎么去处理，当然...

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• 祝让飞 发布于 2017-09-01 16:49

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TCGA和ICGC规定的44种癌症的简称和全称

不知道大家是不是需要中文译名。 lamlAcute Myeloid LeukemiaaccAdrenocortical carcinomablcaBladder Urothelial CarcinomabocaBone CancerlggBrain Lower Grade GliomabrcaBreast invasive c...

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• 生信菜鸟团 发布于 2017-08-29 20:56

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TCGA RNAseq数据中FPKM与TPM转换介绍

在新版数据中TCGA的RNAseq数据主要提供了三种数据下载，FPKM，FPKM-UQ,Counts，如果要用edgR等筛选差异的话会下载使用Counts数据，但是笔者在过去的数据分析中发现TCGA数据使用edgR等软件筛选差...

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• 祝让飞 发布于 2017-08-24 10:41

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批量计算生存分析工具使用例子

以下我们使用GEO的一套数据来演示以下该工具使用 首先我们选择下载GSE25065数据集，下载之后使用GEO芯片数据转换器将数据提取出来，最终我们得到了这两个文件 打开SampleInfo.xls文件找到随访...

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• 祝让飞 发布于 2017-08-16 15:39

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批量计算生存分析工具说明

生存分析：对一个或多个非负随机变量进行统计推断，研究生存现象和响应时间数据及其统计规律的一门学科,既考虑结果又考虑生存时间的一种统计方法，并可充分利用截尾数据所提供的不完全信息，对...

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• 祝让飞 发布于 2017-08-16 14:30

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TCGA ID转换器使用案例

以TCGA简易下载工具下载数据为例，首先下载工具下载之后合并矩阵会得到一个名字为：Merge_matrix.txt 的矩阵 矩阵格式上满足本工具的要求： 打开本工具界面极其简单如下： 从图中可以看...

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• 祝让飞 发布于 2017-08-04 21:42

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TCGA ID转换器使用说明

为了便于新版TCGA RNA-Seq数据的转换提取，特制作RNA-Seq数据的ENSG_ID转换成lncRNA、编码蛋白基因、假基因等的转换器

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• 祝让飞 发布于 2017-08-04 17:05