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  • oscarwang 生信一期  星标用户 2018-04-27 14:02

survivalROC如何输出置信区间？

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5 TCGA简易下载工具的临床随访数据中Clinical BCR Biotab,Clinical BCR XML,Clinical BCR OMF XML分别代表什么意思

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在筛选DEGs时，P值确定，如何通过判断FC值的大小来判断上调与下调表达

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excel 转成TXT后数据列对不齐，导入火山图软件后画出来的图不准

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  • x131 2021-04-26 10:26

13 请问http://sangerbox.com/TcgaDown下载的数据是log化的，还是没有log化的？

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小工具下载的甲基化数据怎么看？没有基因名字的吗？

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5 WGCNA分析的数据问题和表型相关性问题

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  • ZaCH 2018-03-23 11:35

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通路包括什么通路？GO. KEGG吗？作图的话cytoscape怎么做KEGG通路图？请教大神！

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请问，通过TCGA简易工具下载的miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling（数据类型是芯片数据吗？）可以做miRNA差异表达分析吗？如果可以的话，用DECenter小工具时应选的方法是limma(芯片），还是edgR（counts数据）

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TCGA简易工具下下来的CNV数据中的segment_mean是和正常组织比对之后的gain/loss的倍数吗？能否直接拿来作图？

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GEO芯片数据转换器

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