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15 TCGA下载工具中,请问ENSG_ID转换成Gene_symbol，是对那个文件进行操作？将keys的ENSG转换为gene名称？

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  • zero 2018-09-12 09:26

wgcna分析tcga的数据，好多基因表达为0，可以删除这些基因吗？怎么删除？谢谢！

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TCGA简易工具下下来的CNV数据中的segment_mean是和正常组织比对之后的gain/loss的倍数吗？能否直接拿来作图？

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哪里可以下载GEO芯片数据转换器？

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用r的edgeR包跑出来的结果与DECenter中的结果不符

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  • XL 2018-11-19 09:36

用survivalROC包做ROC曲线出问题了

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基因symbol注释GEO芯片时，如何把mRNA和lncRNA分别标注出来？

2 回答

GEO的series.matrix数据需要均一化么？combat小工具输出的数据读入R作为矩阵，报错呢？

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  • zjc 2017-09-29 15:43

向各位大神请教TCGA样本数据库里有DMFS的信息如何找到，我只找到了OS和RFS？谢谢

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20 WGCNA尚未运行完毕，结果只运行了一半

2 回答

pheatmap美化

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3 怎么解释UCSC Xena提供的临床信息？哪些是最重要的？

1 回答
  • 祝让飞 生信一期  星标用户 2017-03-29 10:26

3 illumina测序的reads的产量主要取决于什么？

1 回答

miRNA差异表达分析结果与生存分析不一致，数据能否发表

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TCGA中的甲基化数据分析

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3 找不到Arraystar Human LncRNA microarray V2.0 平台的注释文件

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用批量生存分析工具做生存分析

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FPKM转换TPM后的分析方法

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3 按照教程多个GEO数据集差异分析结果进行综合，RRA工具报错

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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