关于Omisc Core WES 计算TMB的一点见解

TMB

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• chendz
• 发布于 2019-12-06 11:37
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NGS基础 - 高通量测序原理

NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析、ChIP-seq分析、DNA甲基化分析、重测序分析五部分内容。 NGS基础系列文章包括高通量测序原理，测序数据获取和质量评估，常见文件格式解释和转换4部分。

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• shengxinbaodian
• 发布于 2018-08-27 20:22
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数据分析技巧、基因定位文献解读合辑

这一期的合辑包括数据分析技巧和基因定位经典文献的解读。

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• 组学生物
• 发布于 2018-03-12 14:53
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除了表达芯片，还有基因型芯片

想得到基因型，不一定需要测序，WGS,WES都太麻烦，已经有设计好的基因型芯片 各种基因型芯片的异同点

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• 生信菜鸟团
• 发布于 2017-08-29 20:52
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你得明白为什么一个基因对应多个探针

一个基因对应多个探针

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• 生信菜鸟团
• 发布于 2017-08-29 20:50
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各种平台的表达芯片跟mRNA-seq数据比较

文章见：http://journals.plos.org/plosone ... ournal.pone.0078644指定的细胞系是：Human CCR6+ CD4 memory T cell ，测了6个时间点，共12个样本表达芯片用的是Affymetrix GeneChip HT HG-U13...

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• 生信菜鸟团
• 发布于 2017-08-15 07:43
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illumina的450K芯片的beta值含义及计算方法

illumina的软件(Illumina GenomeStudio Software)自动就把450k芯片的IDAT原始文件转换成了甲基化信号文件,一般是3~8列值每个样本。A beta value was calculated for each CpG target with Illum...

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• 生信菜鸟团
• 发布于 2017-08-10 22:59
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illumina的bead 系列表达芯片扫盲

表达芯片大家最熟悉的当然是affymetrix系列芯片啦，而且分析套路很简单，直接用R的affy包，就可以把cel文件经过RMA或者MAS5方法得到表达矩阵。illumina出厂的芯片略微有点不一样，它的原始数据...

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• 生信菜鸟团
• 发布于 2017-08-10 22:58
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测序简史

一文从一代到最新的测序技术，希望能够帮助你。

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• 张海伦
• 发布于 2017-07-25 17:46
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纳米孔测序技术介绍

纳米测序即将来临。

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• SXR
• 发布于 2017-03-30 21:57
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第一代测序技术介绍

黄金的一代测序

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• SXR
• 发布于 2017-03-28 20:57
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