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对方向扔了一个赤果果的生信分析SCI思路

很久没有写稿子了，今天给大家分享一篇纯生信的SCI,思路简单粗暴。文章2017年发表在Oncotarget上(虽然已经牺牲了)，但是我们可以取其精华呀，只要还有值得我们学习的地方，我们就挖掘出来。

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• 生信分析流 发布于 2018-12-04 21:32

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miRNA与lncRNA的关系网络构建

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。本节主要lncRNA与miRNA的关系对构建。

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• 调研图 发布于 2018-11-16 14:48

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第三篇lncRNA signature的文章解析，IF五分胶质瘤

这是一篇比较老的建模的文章，发表在Neurobiology of Disease上，目前影响因子五分多点。 Long non-coding RNA expression profiles predict clinical phenotypes in glioma 本文从lncRNA...

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• 祝让飞 发布于 2018-10-09 17:06

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两篇胃癌lncRNA signature文章解读之二（IF=3.2）

这是一篇2017年的文章，文章从lncRNA的角度筛选lncRNA signature，该文章发表在Journal of Cancer上，影响因子如下： 文章题目为：Differentially Expressed lncRNAs in Gastric Cancer Patien...

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• 祝让飞 发布于 2018-10-09 09:06

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两篇胃癌lncRNA signature文章解读之一（IF=7.7）

这是一篇2016年的文章，文章从lncRNA的角度筛选lncRNA signature，该文章发表在Molecular Cancer上，影响因子如下： 下面我们一起来解析一下这篇文章 文章标题如： 看signature大体思路...

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• 祝让飞 发布于 2018-10-08 21:01

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人类lncRNA 简介

Part 1.目前研究相对比较透彻的lncRNA汇总 与癌症相关lncRNA lncRNA长度Cytoband癌症类型HOTAIR2158nt12q13.13乳腺癌MALAT1/a/NEAT27.5 kb11q13.1乳腺癌、肺癌、子宫癌、胰腺癌、宫颈癌、前...

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• 生信分析流 发布于 2018-09-13 15:37

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MALAT-1简介

MALAT-1的发现2003年，Ji等从初期非小细胞肺癌患者的肿瘤细胞中筛选出数个差异表达基因，其中包括含一个与肺癌转移和预后相关的未知转录物，采用RACE法扩增到一个长约940nt的片段，经检索比对...

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• 生信分析流 发布于 2018-09-13 15:00

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使用TCGA做CeRNA又有了便捷的方法

在早先时候我介绍了CeRNA的一些做法，尤其是怎么构建CeRNA网络和怎么去对网络做剪枝，在视频中都是针对于不需要编程去操作，实际上如果你会R的话，下面介绍的工具会让你事半功倍。 这是一篇上...

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• 祝让飞 发布于 2018-08-13 09:52

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exoRBase: a database of circRNA, lncRNA and mRNA in human blood exosomes

exoRBase一个整合血液外泌体RNA的数据库。

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• 张海伦 发布于 2017-10-13 09:51