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Homo_sapiens.GRCh38.90 中的 gene_id 的格式一定是：“大写字母+数字+（小数点+数字）”吗？

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经GEO芯片转化器后，很多基因名有斜杆，这个怎么处理？

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3 GEO数据meta分析时怎样在每一个数据集中剔除不需要的分组内的样本

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5 affy芯片标准化

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TCGA小工具下载的RNAseq的FPKM数据 可以直接做t检验 和 FC值，找差异基因吗

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特定细胞系转录因子表达谱

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GSEA运行出错，如图。

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3 老师您好，想问下用贵公司盒子下载的TCGA的miRNA数据，如何合并得到read count数据（目前自动合并的是标化后的）？

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  • xdh 2019-11-23 10:39

5 基因count数与转录本count数差别极大吗？

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3 有人做过基因芯片重注释吗？

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5 两个不同平台的RNA-seq或芯片，我可以Z值均一化后再做PCA吗

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3 生存分析样本要求

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怎么做单基因的癌和癌旁差异分析？

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5 TCGA下载的miRNA isoform表达谱分析

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请问老师们，从TCGA官网上利用GDC tool下载结肠癌基因表达的counts数据，和使用R包-TCGAbiolinks下载，得到的样本数量不一致，请问是什么原因？有遇到这样的情况的吗？

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10 hisat2+stringtie+ballgown得出的结果出现两个相同基因的FPKM值，如何处理？

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差异基因分析

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在线功能富集分析工具除了DAVID网站外，还有哪个网站啊？

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芯片重注释之后，发现探针对应的基因不唯一

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请问将RNA-seq数据转换成Merge_matrix.txt.cv 和 Merge_matrix.txt.cv.lnc 之后，Merge_matrix.txt.cv文件里还包含LINC的原因

今天，你的分析遇到什么问题呢？

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