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wongkj
2022-04-12 11:21
祝老师,我走hisat2+featurecounts+DESeq2得到count矩阵,对ensemble ID进行symbol转换时,存在多个ID对应一个symbol的情况,请问count矩阵应该怎么合并基因count表达值,有代码可以参考吗?
RNA seq
count
1
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5822
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放牛班の春天
2017-07-21 08:55
5
WGCNA使用疑问
WGCNA
module
1
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5772
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pengtao
2018-07-26 22:31
下载TCGA的mRNA数据,里面很多数值是什么
TCGA
相关性
2
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5746
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风从扇来
2018-08-29 17:02
GPL570同一个平台下,准备分析9套数据,是否可以RAW原始数据合并?
GEO
RRA
0
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5670
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wongkj
2022-04-12 11:14
RNAseq 用hisat2+featurecounts+DESeq2流程得到count矩阵,先根据ensembl ID转换成gene symbol,出现多个ID对应一个symbol的情况,需要对基因的count值进行合并,请问可以用什么方法,可以提供下代码参考吗?
RNA seq
count
1
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5662
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挖挖
2018-04-05 21:22
RNA-seq的GSEA
GSEA
0
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5638
浏览
李厚诚
2019-09-16 09:37
如何从转录组数据中筛选出转录因子
转录因子
1
回答
5537
浏览
Diespolen
2020-05-23 20:38
3
GEO下载的FPKM矩阵如何转化成TPM?
RNA-seq分析
1
回答
5506
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臧竹青
2017-06-22 11:16
在ucsc下载的tcga数据库,怎样简单的用excel做癌组织与正常组织的转录组差异表达分析
1
回答
5487
浏览
令狐伯通
2017-07-24 01:17
fisher检验富集分析
富集分析
1
回答
5469
浏览
leedewhat
2017-09-25 17:05
请教:同一个基因对应多个探针名,想取个平均值
1
回答
5457
浏览
夜神月
2018-01-13 01:32
TCGA甲基化下载问题
TCGA
甲基化
0
回答
5377
浏览
∞一克拉左小
2017-12-05 17:20
WGCNA分析性状构建
WGCNA
1
回答
5326
浏览
朱振华
2017-09-22 15:49
WGCNA中,如何将训练集中产生的模块特征基因(ME)应用于测试集,进而进行生存分析?
WGCNA
1
回答
5274
浏览
hjzhang
2017-06-13 15:19
怎么从TCGA下载的数据中提取lncRNA的信息?求详细步骤,恳请大侠指点详细步骤
1
回答
5262
浏览
梁朝伟
2017-09-11 20:36
WGCNA分析
WGCNA
1
回答
5129
浏览
冯博孩
2020-03-01 18:58
20
TCGA下载后LncRNA_ID注释问题
lncRNA
0
回答
5097
浏览
王生
2020-11-01 16:01
lncRNA重注释问题
lncRNA
GEO
重注释
2
回答
5055
浏览
YhuiC
2018-01-22 19:47
经GEO芯片转化器后,很多基因名有斜杆,这个怎么处理?
1
回答
5038
浏览
sands58
2017-08-22 22:24
5
affy芯片标准化
GEO
标准化
归一化
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