1. R 包的下载与安装 1.1 为什么要使用R 包? R 语言下载安装后,有很多基础函数可以使用,满足我们大部分需求。但在进行一些特定的分析时,需要用到一些人开发的R 包。 目前有很多R 包可
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源自最初在细菌中发现的基因,CRISPR被描述为“分子剪刀”。它将一段遗传密码换成另一段遗传密码。在CRISPR-Cas9系统中,Cas9是切割DNA的酶。 图片来自Cell, doi:10.1016/j.cell.2018.09.001。 在过去
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文章通过对TCGA中的PDAC甲基化以及表达等数据进行分析,使用差异表达,生存分析,功能富集等生信方法,最终识别出了PDAC的预后标志物。
在临床预测模型的研究中,数据集纳入之后对不同数据集的临床特征统计是必要的一个步骤,我们需要比较不同的组别的样本的临床特征比如年龄分布,Stage分布等,在这里我们开发了一个 简易的Excel...
柱状图很常见,但漂亮的柱状图不常见,这里我们开发了一个 简易的柱状图绘制工具,支持几种比较炫酷的柱状图的绘制,输入界面很简单: 直接从Excel 复制过来就好了,输入数据之后,在页面下方...
“在生信分析之前对数据进行清洗,其过程对后续的分析起的重要的作用,有时直接影响结果的好坏”
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这是一款简易的 配对样本的 检验和可视化工具,支持配对T检验和秩和检验,同时也支持一组和多组数据的可视化统计分析。 使用方式简单,跟用Excel一样,如下: 结果部分,分两种,一种是图,...
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众所周知,现阶段研究肿瘤基本离不开TCGA,研究单个基因的话更离不开单个基因在泛癌中的表达及与免疫的关系。 在这里我们介绍一个傻瓜式的工具助你高效的分析,不用输入数据,鼠标点点点即可,...
2. R 语言常用的数据类型 数值型:如1, 2, 3 基本操作: 字符型:如 "haha", "a12", "1", "2", "123" 基本操作: 逻辑型:逻辑型只有两个:TRUE(T) 、FALSE(F) 基本操作: 数据类型之间的转换: 最
如果是以文件的格式将数据导入到云平台,平台默认无法读取Excel中的数据,必须将Excel文件转为以制表位符分割的文本文件,否则小工具将无法运行。
基于表格数据绘制的气泡的,可用于任何数据的四个维度的展示,和使用Excel一样方便。 在做富集分析的结果可视化中使用尤其适合,即需要展示显著性、也需要展示富集基因个数和富集程度,这里就...
感觉自己的数据没有啥问题啊搞了好久都不知道问题出在哪儿,希望老师可以给我答疑,非常感谢!补充:1. 数据表达信息因为我是用limma分析差异表达miRNA的所以标准化时选择了log2处理,图4的三个miRNA是从差异表达的表里面选出来的。2. 临床信息中我的OS与前面两列的和不一样,我直接用了小工具给出的A1_OS 和A2_Event。不知道会不会有影响。