生信分析流
【助研】【博后】【中科院】中科院心理所生物信息实验室助研及博士后招聘启事
王晶研究员研究组主要从事精神疾病多组学数据挖掘的生物信息技术开发以及精神疾病的候选分子标志物研究。目前因研究工作需要，招聘如下人员： 一、岗位需求：助研1人，岗位博士后1人 二...
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- bioinfo
- 发布于 2018-03-24 15:53
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bioinfo
记一次ORFfinder本地化所遇到的问题
本地化ORFfinder本来是一件相当简单的事情，NCBI已经做的足够简洁，下载ORFfinder二进制文件，然后就可以了，但是我这边却遇到了难题。
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- deepxin
- 发布于 2017-09-18 19:47
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deepxin
张海伦
Windows不用虚拟机或双系统，轻松实现linux shell环境：gitforwindows
windows缺少shell命令支持 用过Linux服务器分析数据的小伙伴，一定对Linux强大Shell命令所折服，经常会感觉windows缺少这些命令而感觉不方便。 还有想学习Linux Shell命令的小伙伴，一直没有...
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- 刘永鑫
- 发布于 2018-02-11 23:05
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刘永鑫
勤能补拙，过目不忘，提高m6A助力好记性？中科院王秀杰/杨运桂合作最新成果
CellRes | 王秀杰组联合杨运桂组揭示RNA m6A修饰影响长时记忆形成效率长时记忆的形成（long-term memory formation）是哺乳动物适应环境变化、智力发展所必需的，对于人类的社会活动尤其重要。大脑
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- shengxinbaodian
- 发布于 2018-10-26 18:00
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shengxinbaodian
文献解读（7）肺ADC中的空间甲基化异质性
为了重建组织形态学模式的克隆进化，本研究对27个原发性肿瘤区域，7个匹配的正常组织和7个ADC病例的6个淋巴结转移进行了整体DNA甲基化分析。结果表明，表观基因组特征的广泛变化有助于原发性ADC和淋巴结转移的分子和表型异质性。
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- 柚子
- 发布于 2019-11-25 13:41
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柚子
文献解读（1）What?这篇文章为预测预后和发现抗转移药物提供了帮助?
从单细胞测序数据入手，结合多种生物信息方法，筛选了基于scRNA-seq的标记基因，并在大量ccRCC样本中进行了验证。不仅描述了pRCC和mRCC的基因组特征和异质性，还发现了一些MAGs，为预测预后和发现抗转移药物提供了可能的帮助
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- 柚子
- 发布于 2019-11-27 17:24
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在R语言中关于目录的问题小结
在敲了很多R脚本，然后需要互相引用的时候就会遇到路径问题了 1、如果获取当前工作目录使用： getwd() 2、获取R 包安装目录使用: .libPaths()[1] 3、获取R脚本当前目录咋整？ 这个问题其...
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- 祝让飞
- 发布于 2017-09-30 15:13
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祝让飞
一只临床狗如何从零基础学习生信成为生信大神的？敬请期待连载
从来没有想到自己会有这样的幸运，刚刚接到生信人的邀请，成为第一批临床同学加入到生信逆袭训练营，之后的几个月，我将经常性的骑车到生信人位于杭州余杭的总部学习。 对不起，我现在的心情...
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- 王国胜
- 发布于 2017-10-24 22:11
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王国胜
免疫治疗系列（一）——节后第一天，温习故事吧！
我们生物科研工作者对诺贝尔奖一定不感到陌生。今年10月1号， 2018年度诺贝尔生理学或医学奖（我一直觉得这里用个和是不是语法更通顺，但是不重要）颁布的消息刷爆了小
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- 生信分析流
- 发布于 2018-10-08 11:20
- 阅读 ( 4749 )
真正做到“零基础、零代码、高质量”生物信息学习方法，发表文章，事半功倍
由于现在网络的发达，大部分生物、医学方向的同学都已经知道生物信息学是对 提升科研效率，发文章 是极其有帮助的，然后都想学。 确实，看到这些炫酷的图真是眼馋，加上几幅，文
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- 生信分析流
- 发布于 2018-08-16 17:30
- 阅读 ( 4749 )
文章分享（三）iCCA的亚型与基因组、表观组、预后以及细胞来源的差异的关系
结合多组学的数据，识别肝内胆管细胞癌的亚型，并对这些亚型拷贝数改变情况、甲基化（如：发生的位置，高甲基化的基因所参与功能）以及各亚型预后等方面进行系统地刻画。
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- 柚子
- 发布于 2019-07-25 13:29
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pre-mRNA中存在的修饰及其对剪接影响
撰文丨苗苗 责编丨迦溆 日前，作为“诺贝尔奖风向标”的拉斯克奖——拉斯克·科什兰医学特殊成就奖颁给了Joan Argetsinger Steitz教授（致敬Joan Steitz！2018年拉斯克特别成就奖获得者），以表
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-09 07:56
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文献解读（4）m6A修饰可能和AML疾病的发生发展相关？TP53突变特征与m6A调控基因发生基因组学改变存在一定的关系？m6A对生存有影响？m6A修饰发生基因组学上可以改变相关的临床特征？
m6A：m6A甲基化(Methylation of N6 adenosine) AML：急性髓性白血病（acute myeloid leukemia） OS：整体生存（overall survival） EFS：无事件存活率（event-free survival）
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- 柚子
- 发布于 2019-11-25 11:40
- 阅读 ( 4712 )
文献分享（3）sEV相关基因表达特征(3-PPI-Mod)与肿瘤内缺氧状态显著相关???
这项研究结合生物学网络，以及生存分析，功能富集的生物学方法，开发了一种sEV相关基因表达特征(3-PPI-Mod)，并在独立数据集中进行了验证，其可以预测预后并指导肺ADC的ACT获益，并与肿瘤内缺氧状态显著相关。
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- 柚子
- 发布于 2019-11-25 19:00
- 阅读 ( 4687 )
开挖掘机的老司机告诉你，除了GEO还能挖哪里的数据？
我叫林平之，是一个挖掘机驾驶员，不，应该是莫愁师姐的师弟，呃，有一个小小的问题一直困扰着我。就是要怎么分析别 人家的芯片。GEO虽然好，但感觉Datasets上的芯片真的很少，根本不够用
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- 生信分析流
- 发布于 2018-08-21 11:26
- 阅读 ( 4669 )
SXR
豆浆包子
