孟德尔随机化之遗传学概述
为了理解孟德尔随机化，我们有必要对遗传学有一个粗略的了解。 1. 读取遗传密码 许多生物的遗传信息（或基因组）由长长的一串遗传密码组成，这些遗传密码以DNA（脱氧核糖核酸）的形式?
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- 米老鼠
- 发布于 2020-09-13 23:18
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米老鼠
记录一下windows下安装python2.7包的艰苦经历
一般情况下安装一些python包使用pip就能搞定了，在windows下有些包不被支持可以能就需要一番周折
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- 祝让飞
- 发布于 2017-04-15 15:40
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祝让飞
柚子
免疫治疗系列（一）——节后第一天，温习故事吧！
我们生物科研工作者对诺贝尔奖一定不感到陌生。今年10月1号， 2018年度诺贝尔生理学或医学奖（我一直觉得这里用个和是不是语法更通顺，但是不重要）颁布的消息刷爆了小
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- 生信分析流
- 发布于 2018-10-08 11:20
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生信分析流
小提琴图（箱线图）简易绘制工具
对几组数据进行比较差异并可视化，小提琴图可以说是完美展示了数据分布和差异，在这里我们开发了 简易的小提琴图绘制工具，非常简单，界面如下： 界面太过简单，无需多言，在看结果界面 几组...
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- admin
- 发布于 2021-07-22 21:48
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admin
真正做到“零基础、零代码、高质量”生物信息学习方法，发表文章，事半功倍
由于现在网络的发达，大部分生物、医学方向的同学都已经知道生物信息学是对 提升科研效率，发文章 是极其有帮助的，然后都想学。 确实，看到这些炫酷的图真是眼馋，加上几幅，文
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- 生信分析流
- 发布于 2018-08-16 17:30
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文虎
开挖掘机的老司机告诉你，除了GEO还能挖哪里的数据？
我叫林平之，是一个挖掘机驾驶员，不，应该是莫愁师姐的师弟，呃，有一个小小的问题一直困扰着我。就是要怎么分析别 人家的芯片。GEO虽然好，但感觉Datasets上的芯片真的很少，根本不够用
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- 生信分析流
- 发布于 2018-08-21 11:26
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MongoDB开启权限认证
本文主要讲解MongoDB开启认证过程中需要完成的事项，包括建立超级用户、如何管理用户、什么是角色、如何赋予角色等等。
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- deepxin
- 发布于 2017-06-08 14:37
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deepxin
谁来调控我感兴趣的DNA？100%可行的全面解决方案
本文关心的是直接调控，即哪个蛋白/RNA直接结合我感兴趣的DNA。研究哪个蛋白质结合某段DNA，有两种方法screen： Plan A：大量ChIP-seq公共数据 Plan B：motif分析预测
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- 生信分析流
- 发布于 2018-11-16 20:46
- 阅读 ( 3664 )
一键式的批量生存分析工具
对于表达谱数据，我们经常需要批量的筛选与肿瘤预后显著相关的基因，在这里我们开发了一个可以批量计算 每个基因与预后相关的工具，界面极简化，傻瓜式操作，如下： 完成后，点击载入结果...
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- admin
- 发布于 2021-07-26 18:19
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单因素生存分析工具在线版等你来用！R语言都不用安装？
“做cox比例分析和KM曲线结合分析，阈值该怎么选取，数据是否需要标准化等等问题的解决方法”
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- 柚子
- 发布于 2020-05-26 10:25
- 阅读 ( 3645 )
Python - 我写代码时如果有一行过长该怎么处理？
Python的编码规范要求每行的长度不超过80，那就就有一个问题，如果我真的需要在一行写80个字符以上的代码怎么办？
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- deepxin
- 发布于 2017-06-23 11:31
- 阅读 ( 3644 )
怎样使用Sangerbox进行文献分析
怎样使用Sangerbox进行文献分析 怎样使用Sangerbox进行文献分析 怎样使用Sangerbox进行文献分析
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- 祝让飞
- 发布于 2019-12-17 15:08
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文章分享（三）iCCA的亚型与基因组、表观组、预后以及细胞来源的差异的关系
结合多组学的数据，识别肝内胆管细胞癌的亚型，并对这些亚型拷贝数改变情况、甲基化（如：发生的位置，高甲基化的基因所参与功能）以及各亚型预后等方面进行系统地刻画。
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- 柚子
- 发布于 2019-07-25 13:29
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文献解读（7）肺ADC中的空间甲基化异质性
为了重建组织形态学模式的克隆进化，本研究对27个原发性肿瘤区域，7个匹配的正常组织和7个ADC病例的6个淋巴结转移进行了整体DNA甲基化分析。结果表明，表观基因组特征的广泛变化有助于原发性ADC和淋巴结转移的分子和表型异质性。
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- 柚子
- 发布于 2019-11-25 13:41
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文献解读（1）What?这篇文章为预测预后和发现抗转移药物提供了帮助?
从单细胞测序数据入手，结合多种生物信息方法，筛选了基于scRNA-seq的标记基因，并在大量ccRCC样本中进行了验证。不仅描述了pRCC和mRCC的基因组特征和异质性，还发现了一些MAGs，为预测预后和发现抗转移药物提供了可能的帮助
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- 柚子
- 发布于 2019-11-27 17:24
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【精品思路在手，高分Paper不愁】转录组数据-免疫微环境精品分析思路（三）
作者刻画了结直肠癌（ CRC）的免疫表型和抗原基因组特征，描绘了肿瘤和免疫细胞的关系，试图揭示肿瘤的逃逸机制并寻找免疫治疗的 biomarker。 思路导图： 数据来源：作者利用 TCGA中结
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- 生信分析流
- 发布于 2019-05-23 11:03
- 阅读 ( 3606 )
pre-mRNA中存在的修饰及其对剪接影响
撰文丨苗苗 责编丨迦溆 日前，作为“诺贝尔奖风向标”的拉斯克奖——拉斯克·科什兰医学特殊成就奖颁给了Joan Argetsinger Steitz教授（致敬Joan Steitz！2018年拉斯克特别成就奖获得者），以表
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- 祝让飞
- 发布于 2018-10-09 07:56
- 阅读 ( 3604 )
