热门的文章 - 第27页

宽数据转换成长数据简易工具

处理数据常常会遇到两张数据格式，一种是长数据（long data），另一种是宽数据（wide data）。以常见的股票收盘价数据为例，表1是长数据常见形式，而表2是宽数据常见形式。而R语言作为处理数...

0
0
admin
发布于 2021-06-27 20:52
阅读 ( 4209 )

2018学术影响力排名前100名期刊推荐！

8月2日，Google Scholar发布了2018年最新的学术期刊影响力排名。

0
0
生信分析流
发布于 2018-08-10 11:40
阅读 ( 4200 )

实战系列（三）模仿4分胃癌发病机制和预后关键基因的文章

DOI ： 10.3389/fgene.2018.00265我们桑格助手的读者一定明白给 DOI是为什么，如果万一第一次看本公众号的文章，不明白，我稍稍解释一下，通过DOI可以浏览到文献的全文（我们不说下载(#^.^#）桑格助

2
0
生信分析流
发布于 2019-07-10 09:47
阅读 ( 4191 )

文献分享（9）m6A调控子在33种癌症类型中的分子特征和临床相关性

通过以上分析作者发现m6A调控子存在广泛的遗传改变，并且它们的表达水平与癌症标志相关通路的活性显著相关。此外，发现m6A调控子可能对预后分层有用，将IGF2BP3鉴定为跨多种癌症类型的潜在致癌基因。该文章的结果提供了宝贵的资源，将指导m6A调控子在癌症中的作用的机理和治疗分析。

0
0
柚子
发布于 2019-11-25 20:05
阅读 ( 4178 )

节后第一篇--如何用生信去挖掘新型甲基化预后标记

节后第一篇推送，首先当然是祝大家节日快乐！！传统意义上，过完初十五，这个年，才算彻底过完。在节日里我们肯定许下了各种美好心愿，节日过完，该向着我们的目标出发了！拿一

0
0
chris
发布于 2019-03-21 12:53
阅读 ( 4167 )

SCHISM 构建克隆进化树

SCHISM介绍 SCHISM是一种计算工具，旨在推断亚克隆层次结构和肿瘤从体细胞突变的演变。推理过程涉及肿瘤进化的两个基本属性的计算评估：谱系优先规则和谱系分歧规则基于体细胞突变细胞...

0
0
吴婷婷
发布于 2018-09-26 17:08
阅读 ( 4165 )

利用这个神经网络模型，作者分别在训练集、验证集和测试集实现了82.8% (AUC = 0.90)、83.0% (AUC = 0.93)和85.7% (AUC = 0.94)的IDH预测精度。当诊断年龄纳入模型时，训练、验证和测试的准确率分别增加到87.3% (AUC = 0.93)、87.6% (AUC = 0.95)和89.1% (AUC = 0.95)。表明这种深度学习技术能够实现非侵入性的高效准确预测II-IV级胶质瘤的IDH基因型，有助于指导治疗决策。

0
0
柚子
发布于 2019-11-26 14:48
阅读 ( 4160 )

193种已发表植物基因组植物

截止 2018 年 4 月，约有 193 种植物完成了基因组测序，详情查看下图：

1
0
生信分析流
发布于 2018-08-23 17:02
阅读 ( 4128 )

学习生信的系列书籍

每次遇到有人问怎么学生信时，总会碰到一个尴尬的问题，“有没有什么书可以推荐下”。骤然之下，也不知道该怎么回答。这个问题有点大，想不到一本书可以囊括。而且对提问人的基础和学

0
0
shengxinbaodian
发布于 2018-08-27 20:19
阅读 ( 4125 )

生信分析云平台产品开发 - 2样本信息处理

生信分析云平台开发 - 2样本信息处理

0
0
豆浆包子
发布于 2019-08-28 23:10
阅读 ( 4115 )

文献解读（4）预测前列腺癌患者预后的新型分层框架

这些结果凸显了使用更复杂的方法来分析基因组数据的重要性，可能有助于药物靶向，并允许构建结合DESNT和其他临床因素的列线图用于临床管理。

0
0
柚子
发布于 2020-04-14 15:25
阅读 ( 4103 )

文献解析（4）这篇研究确定了一个高效的DNA损伤修复相关风险信号作为预测低度胶质瘤预后的指标！

该signature可区分患者的预后，高风险得分患者生存时间短。时间依赖的ROC曲线、Cox回归和Nomogram模型显示生存signature具有独立的预后效果和较高的预后准确性。结合IDH突变状态，这种风险特征可以进一步细分生存期不同的患者。相关基因的功能分析揭示了与signature相关的基因参与细胞周期和DNA修复的生物学过程，同时这些机制已在患者样本中得到证实

0
0
柚子
发布于 2019-11-26 13:32
阅读 ( 4089 )

这样的三分文章在现在这种时候已经很难得了

今天介绍一篇三分多的文章，这篇文章简单到你难以想象，总结内容涉及到的技能主要在以下六个方面： 1、公共数据集，样本量25个 2、在线工具GEO2R进行差异分析 3、使用DAVID进行差异基因的GO...

2
1
祝让飞
发布于 2019-03-07 15:07
阅读 ( 4082 )

分享一个画堆积柱状图的函数代码

library(ggplot2) library(tidyverse) library(reshape2) plotMutiBar=function(dat,ist=F,xlb='',ylb='',lineCol='black',lineW=0.5,legTitle='Group',showValue=F,showLine=T){ if(ist){...