热门的文章 - 第27页

文献解读（5）对于那些存在整体甲基化水平缺失的病人，使用免疫治疗药物对于这一类病人的生存时间竟然会有显著地改善

PMD：部分甲基化结构域（partial methylation domains） LINE-1/L1：长散布细胞核元件（long interspersed nuclear element-1） TMB：肿瘤突变负荷（tumor mutation burden）

0
0
柚子
发布于 2019-11-25 11:55
阅读 ( 3949 )

小编：无话可说-----我从未见过如此……细致之文章

最近小编读到一篇关于 m6A 修饰的文章，完全被震撼和折服了！！思路之清晰、手段之全面、机制之详尽，让小编甘愿奉上自己的膝盖 …… 毫不夸张的说够得上 Cell 级别（但是为什么没发 Cell

2
0
生信分析流
发布于 2019-08-21 09:37
阅读 ( 3946 )

193种已发表植物基因组植物

截止 2018 年 4 月，约有 193 种植物完成了基因组测序，详情查看下图：

1
0
生信分析流
发布于 2018-08-23 17:02
阅读 ( 3946 )

SCHISM 构建克隆进化树

SCHISM介绍 SCHISM是一种计算工具，旨在推断亚克隆层次结构和肿瘤从体细胞突变的演变。推理过程涉及肿瘤进化的两个基本属性的计算评估：谱系优先规则和谱系分歧规则基于体细胞突变细胞...

0
0
吴婷婷
发布于 2018-09-26 17:08
阅读 ( 3922 )

Python学习极简教程（一）

Python 教程陈同 (chentong_biology@163.com)欢迎来到Python的世界，本教程将带你遨游Python，领悟Python的魅力。本教程专注于帮助初学者，尤其是生物信息分析人员快速学会Python的常用功能和使用方式，

0
1
shengxinbaodian
发布于 2018-08-27 20:23
阅读 ( 3916 )

火山图快速绘制工具

火山图是差异分析中最直观的可视化方式，通过火山图可以直观的观察到表达倍数的整体分布和差异显著性的整体分布，因此是做差异分析必备的可视化方式之一在这里我们开发了简易版本的火山图绘制...

0
0
admin
发布于 2021-07-14 17:40
阅读 ( 3896 )

生信分析云平台产品开发 - 2样本信息处理

生信分析云平台开发 - 2样本信息处理

0
0
豆浆包子
发布于 2019-08-28 23:10
阅读 ( 3890 )

这样的三分文章在现在这种时候已经很难得了

今天介绍一篇三分多的文章，这篇文章简单到你难以想象，总结内容涉及到的技能主要在以下六个方面： 1、公共数据集，样本量25个 2、在线工具GEO2R进行差异分析 3、使用DAVID进行差异基因的GO...

2
1
祝让飞
发布于 2019-03-07 15:07
阅读 ( 3889 )

宽数据转换成长数据简易工具

处理数据常常会遇到两张数据格式，一种是长数据（long data），另一种是宽数据（wide data）。以常见的股票收盘价数据为例，表1是长数据常见形式，而表2是宽数据常见形式。而R语言作为处理数...

0
0
admin
发布于 2021-06-27 20:52
阅读 ( 3876 )

学习生信的系列书籍

每次遇到有人问怎么学生信时，总会碰到一个尴尬的问题，“有没有什么书可以推荐下”。骤然之下，也不知道该怎么回答。这个问题有点大，想不到一本书可以囊括。而且对提问人的基础和学

0
0
shengxinbaodian
发布于 2018-08-27 20:19
阅读 ( 3843 )

GO、KEGG一键化富集分析工具

功能富集分析是解释在不同高通量实验中发现的基因列表的关键步骤，一般我们获得某个基因集（如差异基因）后，希望观察这些基因的功能或者通路时，做富集分析是一种最便捷的方法，在这里我们开发...

0
0
admin
发布于 2021-08-28 21:32
阅读 ( 3831 )

勤能补拙，过目不忘，提高m6A助力好记性？中科院王秀杰/杨运桂合作最新成果

CellRes | 王秀杰组联合杨运桂组揭示RNA m6A修饰影响长时记忆形成效率长时记忆的形成（long-term memory formation）是哺乳动物适应环境变化、智力发展所必需的，对于人类的社会活动尤其重要。大脑

1
0
shengxinbaodian
发布于 2018-10-26 18:00
阅读 ( 3825 )

文献解析（4）这篇研究确定了一个高效的DNA损伤修复相关风险信号作为预测低度胶质瘤预后的指标！

该signature可区分患者的预后，高风险得分患者生存时间短。时间依赖的ROC曲线、Cox回归和Nomogram模型显示生存signature具有独立的预后效果和较高的预后准确性。结合IDH突变状态，这种风险特征可以进一步细分生存期不同的患者。相关基因的功能分析揭示了与signature相关的基因参与细胞周期和DNA修复的生物学过程，同时这些机制已在患者样本中得到证实

0
0
柚子
发布于 2019-11-26 13:32
阅读 ( 3825 )

分享一个画堆积柱状图的函数代码

library(ggplot2) library(tidyverse) library(reshape2) plotMutiBar=function(dat,ist=F,xlb='',ylb='',lineCol='black',lineW=0.5,legTitle='Group',showValue=F,showLine=T){ if(ist){...