山峦图,英文名叫做ridge plot,其实中文并没有统一的称呼,但是由于其外貌高低不平,形式山川,所以我们在这里统一称呼其为“山峦图”,和先前的小提琴图类似(小提琴图(箱线图)简易绘制工具)...
该研究构建了一个方便可行的放射学模型,该模型结合了MRI放射学signature和术前临床危险因素,可预测可切除HCC患者的5年生存率。
哈哈,如果你看到这个标题,千万不要想起咪蒙。小编可是好孩子。 话说也是好多年前的现在,小编懵懵懂懂,傻啦吧唧的选择了这个伟大光荣正确的专业。 那时候天真的认为,等我30岁,小编一定要...
HNC:头颈癌(head and neck cancer) HPV:人类乳头状病毒(human papillomaviruses) TCGA:癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas) FFPE:福尔马林固定,石蜡包埋(formalin-fixed, paraffin-embedded) IHC:免疫组化(immunohistochemistry)
SCHISM介绍 SCHISM是一种计算工具,旨在推断亚克隆层次结构和肿瘤从体细胞突变的演变。推理过程涉及肿瘤进化的两个基本属性的计算评估:谱系优先规则和谱系分歧规则 基于体细胞突变细胞...
作者刻画了结直肠癌( CRC)的免疫表型和抗原基因组特征,描绘了肿瘤和免疫细胞的关系,试图揭示肿瘤的逃逸机制并寻找免疫治疗的 biomarker。 思路导图: 数据来源:作者利用 TCGA中结
在这年末之时,我将之前的笔记都进行了整理和排版,对一些文章进行了删改。感谢简书君,给我的两本笔记加上了连载权限,现在大家已经可以像看一本书一样阅读我写下的东西了。
边测序边分析可能不是梦
核心观点: 1,Most missense disease mutations appear not to impair protein folding or stability ,2,Interaction profiling helps distinguish disease mutations from non-disease var...
该研究开发了一种用于诊断和预后基因signature识别的有效工具箱。它是第一个将meta分析与基因表达分析和ML方法相结合的R软件包工具,用于系统地计算统计上可靠的基因signature。重要的是,该工具不限于特定疾病。该工具为有效分析数据和更好地对疾病进行临床管理打开了新的窗口。
在这项研究中,作者选择了包括22个基因的基因标记集如DSG3 FN1, IGFBP2, CLDN1, HDAC7,和L1CAM等,可用于预测胶质母细胞瘤的预后,基于EMT的状态评估等构建了预后预测公式,在混合的细胞程序中,有效地评估胶质母细胞瘤患者的生存,这将有助于开发新的治疗方法,并为预测胶质母细胞瘤的预后提供新的标志物。
R基因的表观调控控制水稻稻瘟病抗性与水稻产量平衡 写在前面 上海植生所何祖华老师实验室最新(2月2日)发表在Science上的这篇文章短小精悍地讲了水稻一个locus上的两个基因通过蛋白水平的...
今天介绍一篇三分多的文章,这篇文章简单到你难以想象,总结内容涉及到的技能主要在以下六个方面: 1、公共数据集,样本量25个 2、在线工具GEO2R进行差异分析 3、使用DAVID进行差异基因的GO...
“绘制高颜值的基因表达高低与患者生存状态的关系图”
蛋白质或核酸功能的发挥并非依靠自己独立起作用,而是主要通过互作复合物的形式来执行其功能,所以其功能阐释的重点之一是蛋白-核酸或蛋白-蛋白互作研究。我司是国内最早开展分子互作研究的公司...
研究的目的是基于放射学的非侵入性生物标记物来促进治疗相关分子亚型的转译,用于头颈鳞癌患者的治疗选择。
本文主要讲解MongoDB开启认证过程中需要完成的事项,包括建立超级用户、如何管理用户、什么是角色、如何赋予角色等等。
一般情况下安装一些python包使用pip就能搞定了,在windows下有些包不被支持可以能就需要一番周折
在研究中作者使用TCGA数据在多种癌型中从多个角度分析了CT基因的表达与癌症的亚型、分子机制、调控以及预后之间的关系,无论是研究的角度还是方法都值得借鉴
关于识别和验证基于circRNA的特征,该特征可以改善这些患者的术后预后分层的问题。