文献解析（3）是什么基因分类器竟能应用到头颈癌病人预后以及靶向治疗的药物反应评估中？

HNC：头颈癌（head and neck cancer） HPV：人类乳头状病毒（human papillomaviruses） TCGA：癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas） FFPE：福尔马林固定，石蜡包埋（formalin-fixed, paraffin-embedded） IHC：免疫组化（immunohistochemistry）

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• 柚子
• 发布于 2019-11-26 13:08
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我学习的R与shell编程笔记，也许可以帮助想要接触的你

在这年末之时，我将之前的笔记都进行了整理和排版，对一些文章进行了删改。感谢简书君，给我的两本笔记加上了连载权限，现在大家已经可以像看一本书一样阅读我写下的东西了。

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• 王诗翔
• 发布于 2018-02-07 20:35
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学R学系列-01-正则表达式

R语言学习教程-[学R学]：正则表达式

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• 文虎
• 发布于 2018-01-26 21:38
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分子互作的异常是导致孟德尔疾病的普遍原因

核心观点： 1，Most missense disease mutations appear not to impair protein folding or stability ,2，Interaction profiling helps distinguish disease mutations from non-disease var...

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• 涣醒
• 发布于 2018-01-08 20:35
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十年攻克水稻癌症

R基因的表观调控控制水稻稻瘟病抗性与水稻产量平衡 写在前面 上海植生所何祖华老师实验室最新(2月2日)发表在Science上的这篇文章短小精悍地讲了水稻一个locus上的两个基因通过蛋白水平的...

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• SXR
• 发布于 2017-03-30 21:43
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边测序边分析可能不是梦

边测序边分析可能不是梦

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• 百迈客
• 发布于 2017-04-27 17:32
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文献解读（6）一种用于系统计算诊断和预后基因特征的方法研究

该研究开发了一种用于诊断和预后基因signature识别的有效工具箱。它是第一个将meta分析与基因表达分析和ML方法相结合的R软件包工具，用于系统地计算统计上可靠的基因signature。重要的是，该工具不限于特定疾病。该工具为有效分析数据和更好地对疾病进行临床管理打开了新的窗口。

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• 柚子
• 发布于 2019-12-30 17:49
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Weinberg教授继的癌症综述

简述了最近10年肿瘤学中的热点和进展，包括细胞自噬、肿瘤干细胞、肿瘤微环境等等，并且将原有的肿瘤细胞六大特征扩增到了十个.

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• 生信菜鸟团
• 发布于 2017-05-11 15:26
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文献解读(9) What ? 为预测胶质母细胞瘤的预后提供新的标志物？

在这项研究中,作者选择了包括22个基因的基因标记集如DSG3 FN1, IGFBP2, CLDN1, HDAC7,和L1CAM等,可用于预测胶质母细胞瘤的预后,基于EMT的状态评估等构建了预后预测公式，在混合的细胞程序中，有效地评估胶质母细胞瘤患者的生存，这将有助于开发新的治疗方法，并为预测胶质母细胞瘤的预后提供新的标志物。

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• 柚子
• 发布于 2019-11-25 18:45
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这样的三分文章在现在这种时候已经很难得了

今天介绍一篇三分多的文章，这篇文章简单到你难以想象，总结内容涉及到的技能主要在以下六个方面： 1、公共数据集，样本量25个 2、在线工具GEO2R进行差异分析 3、使用DAVID进行差异基因的GO...

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• 祝让飞
• 发布于 2019-03-07 15:07
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绘制热图与预后评分关系的简易工具

“绘制高颜值的基因表达高低与患者生存状态的关系图”

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• 柚子
• 发布于 2020-05-26 09:54
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蛋白-核酸及蛋白-蛋白互作研究

蛋白质或核酸功能的发挥并非依靠自己独立起作用，而是主要通过互作复合物的形式来执行其功能，所以其功能阐释的重点之一是蛋白-核酸或蛋白-蛋白互作研究。我司是国内最早开展分子互作研究的公司...

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• 辉骏生物
• 发布于 2018-11-20 15:49
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文献分享（3）sEV相关基因表达特征(3-PPI-Mod)与肿瘤内缺氧状态显著相关???

这项研究结合生物学网络，以及生存分析，功能富集的生物学方法，开发了一种sEV相关基因表达特征(3-PPI-Mod)，并在独立数据集中进行了验证，其可以预测预后并指导肺ADC的ACT获益，并与肿瘤内缺氧状态显著相关。

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• 柚子
• 发布于 2019-11-25 19:00
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学R学系列-序

R语言学习教程-[学R学]：序

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• 文虎
• 发布于 2018-01-26 21:36
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记录一下windows下安装python2.7包的艰苦经历

一般情况下安装一些python包使用pip就能搞定了，在windows下有些包不被支持可以能就需要一番周折

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• 祝让飞
• 发布于 2017-04-15 15:40
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实战系列（三）模仿4分胃癌发病机制和预后关键基因的文章

DOI ： 10.3389/fgene.2018.00265我们桑格助手的读者一定明白给 DOI是为什么，如果万一第一次看本公众号的文章，不明白，我稍稍解释一下，通过DOI可以浏览到文献的全文（我们不说下载(#^.^#）桑格助

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• 生信分析流
• 发布于 2019-07-02 11:51
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MongoDB开启权限认证

本文主要讲解MongoDB开启认证过程中需要完成的事项，包括建立超级用户、如何管理用户、什么是角色、如何赋予角色等等。

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• deepxin
• 发布于 2017-06-08 14:37
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Python - 我写代码时如果有一行过长该怎么处理？

Python的编码规范要求每行的长度不超过80，那就就有一个问题，如果我真的需要在一行写80个字符以上的代码怎么办？

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• deepxin
• 发布于 2017-06-23 11:31
• 阅读 ( 4170 )

你想要的宏基因组-微生物组知识全在这

本文转载自“宏基因组”，更多文章跳转公众号阅读 宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强本领域的技术交流与传播，推动中国微生物组计划发展，中科院青年科研人员创立“...

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• 刘永鑫
• 发布于 2017-10-12 23:03
• 阅读 ( 4169 )

文献分享（7）circRNA特征预测II / III期结肠癌术后复发

关于识别和验证基于circRNA的特征，该特征可以改善这些患者的术后预后分层的问题。

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• 柚子
• 发布于 2019-11-25 19:47
• 阅读 ( 4168 )