(一) 热性免疫肿瘤的特征 •肿瘤组织中有高密度T细胞和细胞毒性T细胞浸润;(高免疫评分) •检查点分子激活(Checkpoint activation),包括:PD-1(程序性细胞死亡蛋白-1);CTLA4(细胞毒性...
总共统计了生物医药行业近十年的3078个期刊的影响因子,并且注明该期刊大的分类(Category)及小的分类(Subcategory),该期刊未来的走势(上升,下降),供大家投稿作为参考.
想得到基因型,不一定需要测序,WGS,WES都太麻烦,已经有设计好的基因型芯片 各种基因型芯片的异同点
在数据统计和分析过程中经常需要进行多个分组之间的比较,在这里我们开发了 简易的多组比较的 绘图工具,非常简单,支持 小提琴图和箱线图 带点和不带点 四种绘图模式 数据输入界面如下:...
一、分析流程的批量运行顺序 二、分析流程的过程控制
年龄和性别对脑部基因表达的影响?H3K27ac和H3K4me1两个组蛋白marker在ESC和NPC里面的变化区别?剂量效应的差异分析如何下结论呢?KO掉Klf5 基因对ESC分化的影响 干扰BMI1的表达对胚状体和胚...
在研究中作者使用TCGA数据在多种癌型中从多个角度分析了CT基因的表达与癌症的亚型、分子机制、调控以及预后之间的关系,无论是研究的角度还是方法都值得借鉴
“绘制高颜值的基因表达高低与患者生存状态的关系图”
该命令集可以非常方便地向远程主机/服务器上传文件、运行远程脚本、下载文件等。
这项研究结合生物学网络,以及生存分析,功能富集的生物学方法,开发了一种sEV相关基因表达特征(3-PPI-Mod),并在独立数据集中进行了验证,其可以预测预后并指导肺ADC的ACT获益,并与肿瘤内缺氧状态显著相关。
生存分析是分析生存时间的统计学方法,其因变量需要用生存时间和结局状态两个变量来刻画,可以将终点事件是否发生以及发生终点事件所经历的时间相结合起来。生存分析的主要内容有生存时间的分布...
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生信干货~如何从零开始学生信~教程小结 教程都在这
对几组数据进行比较差异并可视化,小提琴图可以说是完美展示了数据分布和差异,在这里我们开发了 简易的小提琴图绘制工具,非常简单,界面如下: 界面太过简单,无需多言,在看结果界面 几组...
关于识别和验证基于circRNA的特征,该特征可以改善这些患者的术后预后分层的问题。
省时又省力,几百个基因做生存分析,挑选对样本的生存状态有显著影响的基因,然后用这些基因进行进一步的做生存分析,绘制ROC曲线。
在该研究中作者分析了NSCLC中的circRNA表达,包括LUAD和LUSC肿瘤及其相邻的正常组织,发现LUAD和LUSC组织不仅具有共同的差异表达模式,而且还具有不同的circRNA表达特征。此外,ROC分析表明hsa_circ_0077837和hsa_circ_0001821具有NSCLC患者的诊断潜力,而hsa_circ_0001073和hsa_circ_0001495可作为NSCLC病理亚型的生物标志物。
作者通过差异表达,差异甲基化,药物靶点预测功能富集等方法,强调了差异甲基化以及差异表达基因在TNBC发展过程中的重要角色。研究最终确定了114个DMEGs,它们能够作为分子标志物有助于TNBC的早期诊断。除此之外作者还识别出了一些靶向这些基因的药物。
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基因表达谱数据、拷贝数变异数据以及相应的临床数据最终构建了多发性骨髓瘤分子关系网络(M3CN)