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富集分析圈图快速绘制工具

本工具专门用于绘制富集结果圈图,输入数据主要为富集结果的三列表格固定的格式,第一列为Term,第二列为p值(可以是-log10(pvalue)),第三列为基因,可以由各种富集分析的软件结果整理而来,...

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  • admin
  • 发布于 2021-09-01 11:25
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微课堂|超大孔填料在蛋白质分离纯化中的应用

超大孔产品层析纯化技术由于其高选择性、灵活性、易放大性等优点,已经成为蛋白质药物纯化中不可或缺的技

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  • 祝让飞
  • 发布于 2018-08-16 10:16
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关于Omisc Core WES 计算TMB的一点见解

TMB

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  • chendz
  • 发布于 2019-12-06 11:37
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简易批量生存分析工具!省时又省力!

省时又省力,几百个基因做生存分析,挑选对样本的生存状态有显著影响的基因,然后用这些基因进行进一步的做生存分析,绘制ROC曲线。

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  • 柚子
  • 发布于 2020-05-26 10:13
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除了表达芯片,还有基因型芯片

想得到基因型,不一定需要测序,WGS,WES都太麻烦,已经有设计好的基因型芯片 各种基因型芯片的异同点

缺失值补全和数据标准化工具

在数据分析过程中必然会面临两种问题,一种数据 数据存在缺失,一种是数据没有标准化,在这里我们提供了 一个简易的一体化的工具用于处理数据缺失补全和数据标准化。 界面如下: 工具界面非常...

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  • admin
  • 发布于 2021-07-22 10:45
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生信分析云平台产品开发 - 6 生信分析pipeline批量运行与过程控制

一、分析流程的批量运行顺序 二、分析流程的过程控制

表达芯片数据预处理四部曲-N,T,B,Q(normalization,transformation,bac

如果得到了一个可靠的表达矩阵,那么后续的一切分析都不是事,非常简单,分分钟做几百个差异分析,富集分析。但是,如果保证你的表达矩阵是可靠的呢?毕竟一般人也就是从GEO里面直接下载作者处...

中文速读微生物组(宏基因组)前沿文献——这个可以有

写在前面 微生物组/宏基因组是当今世界生物科学的热门领域,本领域文章也比较多,有没有人在整理和翻译优秀文章的导读呢?让我们可以用母语快速浏览最新进展,并筛选符合自己口味的研究成果...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-11-13 20:32
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MongoDB GridFS初探

本文以简单明了的方式说明了MongoDB GridFS的使用,看完本文章你将能够使用PyMongo来存取GridFS

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  • deepxin
  • 发布于 2017-06-09 15:12
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如何在 Linux 中查看目录大小?

这是一篇关于如何通过一些常用的命令,显示 CentOS 或 RedHat 中的 Linux 目录大小,以及哪些文件夹占用的空间最大的教程。 搜索当前的 CentOS 或 RedHat 文件夹 您可以使用以下命令,在命令行中??

文献分享(2)患者的生存期和对精准免疫治疗反应的影响

NSCLC:非小细胞肺癌(non–small cell lung cancer) ICIs:免疫检查点抑制剂(Immune checkpoint inhibitors) IC:免疫细胞(immune cell) OS:总体生存(overall survival) PFS:无进展生存期(progression-free survival) TMB:肿瘤突变负荷(tumor mutation burden)

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  • 柚子
  • 发布于 2019-11-25 18:46
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怎样使用Sangerbox筛选目标杂志

怎样使用Sangerbox筛选目标杂志 怎样使用Sangerbox筛选目标杂志 怎样使用Sangerbox筛选目标杂志 怎样使用Sangerbox筛选目标杂志

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  • 祝让飞
  • 发布于 2019-12-17 15:10
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如果做一个发表级的单基因在泛癌中的表达与预后的关系的森林图

众所周知,现阶段研究肿瘤基本离不开TCGA,研究单个基因的话更离不开单个基因在泛癌中的表达及与预后的关系。 在这里我们介绍一个傻瓜式的工具助你高效的分析,不用输入数据,鼠标点点点即可,...

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  • admin
  • 发布于 2021-07-20 13:28
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建模的精髓:可靠性>方法

总结:这篇文章构建模型的方法非常简单,门槛不高。 建模可以有很多角度:关键基因,诊断,复发风险,耐药,转移,预后等等等等 数据可以有多种维度:mRNA miRNA lncRNA,CNV,SNP,甲基化等等等等 要把更多的篇幅放在模型鲁棒性的检验上

文献分享(6)对表观遗传酶进行综合泛癌分析揭示了癌症中表观基因组失调的普遍模式

该研究表明存在超越癌症类型的表观基因组失调的普遍模式,并且全基因组DNA低甲基化和高甲基化的肿瘤内水平由不同的过程控制。

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  • 柚子
  • 发布于 2019-11-25 19:34
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生信干货~如何从零开始学生信~教程小结

生信干货~如何从零开始学生信~教程小结 教程都在这

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  • 娄佳成
  • 发布于 2018-03-23 12:20
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基本的shell编程知识,都在这里了

shell,一种壳层与命令行界面,是Unix操作系统下传统的用户和计算机的交互界面。第一个用户直接输入命令来执行各种各样的任务。 普通意义上的shell就是可以接受用户输入命令的程序。它之所以被称作shell是因为它隐藏了操作系统低层的细节。同样的Unix下的图形用户界面GNOME和KDE,有时也被叫做“虚拟shell”或“图形shell”。

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  • 王诗翔
  • 发布于 2018-02-05 14:16
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