R语言实战系列（二）——数据类型

2. R 语言常用的数据类型 数值型：如1, 2, 3 基本操作： 字符型：如  "haha", "a12", "1", "2", "123" 基本操作: 逻辑型：逻辑型只有两个：TRUE(T) 、FALSE(F) 基本操作： 数据类型之间的转换： 最

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• 发布于 2021-03-14 09:43
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R语言实战系列（一）——R的介绍与安装

1. R 包的下载与安装 1.1 为什么要使用R 包？ R 语言下载安装后，有很多基础函数可以使用，满足我们大部分需求。但在进行一些特定的分析时，需要用到一些人开发的R 包。 目前有很多R 包可

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• 发布于 2021-03-14 09:42
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分享一段比较不同模型的C-index和RMS的代码

已封装成函数，如下： compareRiskModal=function(os,ev,risks){ library('survRM2') library('Hmisc') require(survival) library(survcomp) library(prodlim) os=data$SURVIVAL_...

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• 祝让飞
• 发布于 2019-11-12 15:16
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分享一个画堆积柱状图的函数代码

library(ggplot2) library(tidyverse) library(reshape2) plotMutiBar=function(dat,ist=F,xlb='',ylb='',lineCol='black',lineW=0.5,legTitle='Group',showValue=F,showLine=T){ if(ist){...

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• 祝让飞
• 发布于 2019-10-15 12:35
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• 发布于 2019-10-12 18:01
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• 发布于 2019-10-12 17:58
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• 发布于 2019-10-12 17:53
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R语言实战系列（三）——数据结构

没有哪一个教程可以满足所有人的需求。在阅读教程时，一边动手操作，一边上网搜索更多相关的知识才会学的更快。

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• 发布于 2019-10-12 17:48
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• 发布于 2019-10-12 17:40
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• 发布于 2019-10-12 17:36
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blusom 矩阵计算过程

模块替换矩阵BLOSUM(BLOcks SUbstitution Matrix),用于计算氨基酸替换频率。YouTube上看到一个关于讲解blusom 矩阵计算过程的视频，给出了一个例子：seq1 B A B A seq2 A A A C seq3 A A C C...

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• yami
• 发布于 2019-09-10 11:13
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分享一段从KEGG通路中提取基因互作数据的R代码

从KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）网站上获得差异表达基因所富集通路的XML文件。使用R包XML提取这些XML文件中的relation，entry和group关系。然后利用脚本组合它们从中提取其...

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• 祝让飞
• 发布于 2019-03-21 15:10
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分享一个绘制带置信区间的ROC曲线的代码模板

效果图如： library(timeROC)library(survival)ROC.DSST=timeROC(T=time,        delta=status        ,marker=test.score,        cause=1,weighting="marginal",        times=c(12,12*3,1...

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• 祝让飞
• 发布于 2019-02-18 10:38
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基于源代码的RRA算法原理解析

使用RRA算法做基因表达meta分析的文章很多，基于某个好友博士答辩中涉及到此方法，需要对该算法深入解析，顺道抽空研究了一下（主要是实在看不下去文章直译牛头不对马嘴。。。。。他翻译如下）...

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• 祝让飞
• 发布于 2019-02-15 21:36
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mongodb内存占用过高可行的限制办法

最近服务器卡的要死，后来发现是用来MongoDB在后台建索引，占了 一半的内存，MongoDB本身是一个极耗内存的数据库，你有多少内存他都能吃进去，谷歌之后寻到解决办法如下： 服务器系统是CentOS7...

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• 祝让飞
• 发布于 2018-12-27 08:40
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医学统计学-卡方检验

1. 卡方分布当自由度趋于无穷大时，图形趋于正态分布 # 产生服从卡方分布的观测数为1000的样本 df_n <- seq (1 , 5 ) chisq_data <- function (n ){  x <- seq (- 0.2 , 16 , length = 300 )  prob &lt

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• 生信
• 发布于 2018-08-30 08:58
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Python学习极简教程 （一）

Python 教程陈同 (chentong_biology@163.com)欢迎来到Python的世界，本教程将带你遨游Python，领悟Python的魅力。本教程专注于帮助初学者，尤其是生物信息分析人员快速学会Python的常用功能和使用方式，

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• shengxinbaodian
• 发布于 2018-08-27 20:23
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生物信息之程序学习

作为本科学生物，后来转行生物信息的人，经常会被人问起，为啥学习生物信息了呢？这背后通常会带着一些困惑，生物信息分析好不好学？我读书的时候，实验室纯计算机出身的人员只占很小

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• shengxinbaodian
• 发布于 2018-08-27 20:18
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生信宝典Linux学习系列文章整理

生信宝典推出的Linux从入门到常用命令、软件安装方法、数据处理方法都在这了。没有别的好招，常读，常练，记住了，练熟了，就会了；如果没有时间集中练习，可以来找我们做陪练。反响好

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• shengxinbaodian
• 发布于 2018-08-23 19:16
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ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色)

作者：严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生（生物信息学方向）伪码农，R语言爱好者，爱开源 编者按：数据可视化是解析、理解和展示数据不可缺少的一部分。炫或不炫看个人喜好和功

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• shengxinbaodian
• 发布于 2018-08-23 19:06
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