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三代全长转录组辅助基因预测
N50如何评估组装效果
1. 简介(Introduction) 通过高通量测序识别发现de novo的somatic和germ line 突变,结构变异-SNV,包括重排突变(deletioin, duplication 以及copy number variation)以及SNP的座位;针对重排...
SIFT ——预测氨基酸替代是否影响蛋白功能 SIFT是预测氨基酸替代是否影响蛋白功能的开放性工具,由A*STAR(Agency for Science, Technology and Research)资金赞助,GIS (Genome Institue of ...
收集的各种测序名词解释,Contig,Assembly,等等都在这里了
生信人问答平台文章发布注意事项
细菌基因组简单组装
共线性研究的好软件。
新的转录组标表达定量软件
PASA牛叉的利用转录组预测基因
EVM很好的基因预测整合软件。
基因组注释(Genome annotation) 是利用生物信息学方法和工具,对基因组所有基因和其他结构高通量注释,是当前研究的一个热点。 基因组注释主要包括五个研究方向: (1)重复序列的识别...
1、软件介绍 MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件,在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候,大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。有...
TCGA新版数据下载之前有很多教程,但是都不是特别方便,这里属性就给大家写一个很方便的下载工具,总共7M,下载即用免安装,还支持断点续传。
很多地方都下载不到somatic mutation数据了,新版改版之后已经没有了这样的数据,找到下载不容易,且行且珍惜。
基因组做之前的准备工作。
三代组装各种原理和方法都有。
纳米测序即将来临。