R语言基础绘图——坐标轴调整
R语言基础绘图——线性回归
以TCGA简易下载工具下载数据为例,首先下载工具下载之后合并矩阵会得到一个名字为:Merge_matrix.txt 的矩阵 矩阵格式上满足本工具的要求: 打开本工具界面极其简单如下: 从图中可以看...
为了便于新版TCGA RNA-Seq数据的转换提取,特制作RNA-Seq数据的ENSG_ID转换成lncRNA、编码蛋白基因、假基因等的转换器
Dual RNA seq
简单介绍基因预测方法 现如今随着测序技术的发展,组装一个完整的基因组也是越来越普遍,价格已经不像前些年那样昂贵(当然超大基因组除外),待基因组组装完成后,基因预测将会是接下来需要进...
R语言基础绘图——气泡图
R语言基础绘图——箱线图
生信人问答平台本着知识分享,互助共进的原则,提供给广大生信人分享知识,获取知识的网络平台,在本平台中采用金币作为唯一衡量知识贡献的标准,金币不提供充值,是本平台的知识的象征,他只能由知识产生,产生规则如下
目前已发表的三代全长转录组数据。
一文从一代到最新的测序技术,希望能够帮助你。
R语言基础绘图——面积图
R语言基础绘图——直方图
R语言基础绘图——柱状图
R语言基础绘图——折线图
官网 http://software.broadinstitute.org/gsea/index.jsp
TCGA数据库的肿瘤相关测序数据非常丰富,各种玩法都可以发文章,基本上都是有人带头其余模仿即可
R语言基础绘图——散点图
在组学的文章中经常会看到各种KEGG Pathway,上面的基因经常会被标记成不同的颜色,而不同的颜色代表基因的不同的差异水平,那么除了公司流程中能够将KEGG pathway的基因标上去颜色之外还有什么工具也能方便的标记呢,事实上这是一个数据可视化的过程,在做科研的过程中常常存在不同的需求
为了表示基因在样本中的差异,对于许多个基因的话用火山图感觉挺高大上的,那么对于少数几个基因的话一般用什么来展示其表达差异呢,有很多种办法,比如箱线图,柱状图等等,今天主要用小提琴图来可视化几个基因的差异表达。