文章 - 第28页 - 生信人

生存分析——R语言

用R语言进行生存分析

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爽儿
发布于 2017-08-18 18:05
阅读 ( 21344 )

生物信息毕业生如何走向应用

自扯自蛋

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张海伦
发布于 2017-08-17 21:04
阅读 ( 3646 )

生存分析——基本概念

文章对生存分析的概念以及特点进行初步介绍

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爽儿
发布于 2017-08-17 13:13
阅读 ( 17993 )

批量计算生存分析工具使用例子

以下我们使用GEO的一套数据来演示以下该工具使用首先我们选择下载GSE25065数据集，下载之后使用GEO芯片数据转换器将数据提取出来，最终我们得到了这两个文件打开SampleInfo.xls文件找到随访...

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祝让飞
发布于 2017-08-16 15:39
阅读 ( 14701 )

批量计算生存分析工具说明

生存分析：对一个或多个非负随机变量进行统计推断，研究生存现象和响应时间数据及其统计规律的一门学科,既考虑结果又考虑生存时间的一种统计方法，并可充分利用截尾数据所提供的不完全信息，对...

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祝让飞
发布于 2017-08-16 14:30
阅读 ( 7944 )

芯片研究更重要的是生物学意义的探索

年龄和性别对脑部基因表达的影响？H3K27ac和H3K4me1两个组蛋白marker在ESC和NPC里面的变化区别？剂量效应的差异分析如何下结论呢？KO掉Klf5 基因对ESC分化的影响干扰BMI1的表达对胚状体和胚...

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生信菜鸟团
发布于 2017-08-15 07:47
阅读 ( 2841 )

各种平台的表达芯片跟mRNA-seq数据比较

文章见：http://journals.plos.org/plosone ... ournal.pone.0078644指定的细胞系是：Human CCR6+ CD4 memory T cell ，测了6个时间点，共12个样本表达芯片用的是Affymetrix GeneChip HT HG-U13...

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生信菜鸟团
发布于 2017-08-15 07:43
阅读 ( 5509 )

表达芯片数据预处理四部曲-N,T,B,Q(normalization,transformation,bac

如果得到了一个可靠的表达矩阵，那么后续的一切分析都不是事，非常简单，分分钟做几百个差异分析，富集分析。但是，如果保证你的表达矩阵是可靠的呢？毕竟一般人也就是从GEO里面直接下载作者处...

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生信菜鸟团
发布于 2017-08-15 07:39
阅读 ( 3194 )

Python极其简单的分布式异步作业管理系统RQ入门

RQ是一个极其简单的作业管理系统，具有异步、分布式等特点，本文是一个简单的入门教程。

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deepxin
发布于 2017-08-14 17:19
阅读 ( 3314 )

illumina的450K芯片的beta值含义及计算方法

illumina的软件(Illumina GenomeStudio Software)自动就把450k芯片的IDAT原始文件转换成了甲基化信号文件,一般是3~8列值每个样本。A beta value was calculated for each CpG target with Illum...

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生信菜鸟团
发布于 2017-08-10 22:59
阅读 ( 15689 )

illumina的bead 系列表达芯片扫盲

表达芯片大家最熟悉的当然是affymetrix系列芯片啦，而且分析套路很简单，直接用R的affy包，就可以把cel文件经过RMA或者MAS5方法得到表达矩阵。illumina出厂的芯片略微有点不一样，它的原始数据...

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生信菜鸟团
发布于 2017-08-10 22:58
阅读 ( 5485 )

illumina的Omni系列芯片进化史

希望这个链接不要过时：https://www.illumina.com/Documen ... et_gwas_roadmap.pdf 也就是说，希望illumina公司不要倒闭！Genome-wide association studies(GWAS) have identified hundreds of...