基因组学数据分析常用的在线资源

最前沿的在线资源列表

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  • Bryce
  • 发布于 2017-11-22 23:19
  • 阅读 ( 6622 )

RefSeq注释下载及加工

如何从UCSC下载refseq参考基因注释文件

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  • Jinwen
  • 发布于 2017-11-21 15:47
  • 阅读 ( 13067 )

宏基因组实战8. 分箱宏基因组binning, MqaxBin, MetaBin, VizBin

前情提要 如果您在学习本教程中存在困难,可能因为缺少背景知识,建议先阅读本系统前期文章 宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实战2...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-11-21 09:25
  • 阅读 ( 9784 )

共表达网络揭示组织特异性转录调控和剪接

共表达网络揭示组织特异性转录调控和剪接 背景 基因共表达网络在基因表达数据中可以捕获生物学上重要的模式,使基因的功能分析,生物标记的发现和遗传变异的解释成为可能。目前大多数的网...

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-11-19 10:15
  • 阅读 ( 5708 )

宏基因组实战7. bwa序列比对, samtools查看, bedtools丰度统计

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-11-13 20:33
  • 阅读 ( 7085 )

中文速读微生物组(宏基因组)前沿文献——这个可以有

写在前面 微生物组/宏基因组是当今世界生物科学的热门领域,本领域文章也比较多,有没有人在整理和翻译优秀文章的导读呢?让我们可以用母语快速浏览最新进展,并筛选符合自己口味的研究成果...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-11-13 20:32
  • 阅读 ( 2954 )

一片看懂肠道菌群在人体中的作用

## 影片信息 日文名:腸内フローラ解明!驚異の細菌パワー   中文名:肠道细菌 / 肠道花园   类型:医療健康   时长:49min   官网:http://www.nhk.or.jp/special/detail/2015/0222/  ...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-11-13 20:25
  • 阅读 ( 4442 )

SangerBox 永久下载地址(原生信人工具盒)

SangerBox 新一代数据分析盒子,集成常见的傻瓜式数据分析软件,让你轻松做分析。

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  • 祝让飞
  • 发布于 2017-11-09 16:15
  • 阅读 ( 117809 )

TCGA下载工具V12用教程

由于TCGA下载工具之前的版本中用户无法连接TCGA时无法下载,也无法支持GEO数据下载,本次升级将对上述的两个问题进行解决

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  • 祝让飞
  • 发布于 2017-11-09 16:05
  • 阅读 ( 26724 )

宏基因组实战6. 不比对快速估计基因丰度Salmon

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-11-08 21:09
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宏基因组实战5. sourmash基于Kmer比较数据集

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-11-07 08:56
  • 阅读 ( 7622 )

SesameFG:芝麻功能基因组学的综合数据库

SesameFG为芝麻功能基因组学研究和分子育种提供了宝贵的资源和工具

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  • 调研图
  • 发布于 2017-11-06 21:05
  • 阅读 ( 6494 )

三维基因组常用分析工具汇总

Hi-C技术主要将空间结构临近的DNA片段进行交联,并将交联的DNA片段富集,然后进行高通量测序,对测序数据进行分析即可揭示全基因组范围内的染色体片段间的交互作用。利用Hi-C技术可以揭示基因组...

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-11-06 20:51
  • 阅读 ( 8317 )

芦笋基因组揭示了Y染色体的起源和进化

背景 有花植物中,雌雄异株的植物仅占6%,涵盖约200个科60个属的14600个物种。所有雌雄异株植物有可能进化出性染色体,其中簸箕柳和芦笋等植物的同型性染色体处于进化早期。通常认为植物性染...

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-11-06 20:49
  • 阅读 ( 6624 )

宏基因组实战4.基因注释Prokka

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-11-02 20:54
  • 阅读 ( 11368 )

怎么下载R的老版本

今天为了使用一个R包的缘故,试了好多个R版本,终于安装上 笑哭 那么问题来了,怎么下载老版本的R呢 嗯,记住这个链接:https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/ 所有的版本的R都...

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  • 祝让飞
  • 发布于 2017-11-02 15:05
  • 阅读 ( 9928 )

你想要的宏基因组-微生物组知识全在这(180701)

宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一,为加强本领域的技术交流与传播,推动中国微生物组计划发展,中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号,目标为打造本领域纯干货技术及思想交流平台。

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-10-31 20:15
  • 阅读 ( 5694 )

宏基因组实战3. MEGAHIT组装拼接及quast评估

前情提要 如果您在学习本教程中存在困难,可能因为缺少背景知识,建议先阅读本系统前期文章 宏基因组分析理论教程微生物组入门圣经+宏基因组分析实操课程1背景知识-Shell入门与本地blast实战2...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-10-30 17:50
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Python Schema使用说明

Python Schema一种优雅的数据验证方式

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  • deepxin
  • 发布于 2017-10-30 14:27
  • 阅读 ( 4521 )