这样的三分文章在现在这种时候已经很难得了

今天介绍一篇三分多的文章,这篇文章简单到你难以想象,总结内容涉及到的技能主要在以下六个方面: 1、公共数据集,样本量25个 2、在线工具GEO2R进行差异分析 3、使用DAVID进行差异基因的GO...

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  • 祝让飞
  • 发布于 2019-03-07 15:07
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生信人简史

哈哈,如果你看到这个标题,千万不要想起咪蒙。小编可是好孩子。 话说也是好多年前的现在,小编懵懵懂懂,傻啦吧唧的选择了这个伟大光荣正确的专业。 那时候天真的认为,等我30岁,小编一定要...

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-06-23 20:58
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超简单!每个样本只要10元的转录组分析教程

十元十元? 第一次写教程还是要标题党一下。不过十元并不夸张,十元真的买不了吃亏,买不了上当。作为一个临床外科小大夫,写生物分析教程,求专业级别的人放过。看中结果,忽略过程中的瑕疵。...

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  • 娄佳成
  • 发布于 2018-01-18 15:55
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富集分析结果展示(二)——富集分析圈图

“做cox比例分析和KM曲线结合分析,阈值该怎么选取,数据是否需要标准化等等问题的解决方法”

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  • 柚子
  • 发布于 2020-05-26 10:06
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多因素回归模型简易分析工具

内嵌视频 正在内测中,请勿扫码。

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  • 祝让飞
  • 发布于 2018-04-10 21:48
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腺病毒实验5大问题及解决对策

如何解决细胞感染病毒后高死亡率的问题? 1) 一些细胞株有类似E1区活性 若一定要使用该细胞株,改用较低MOI。 2) 细胞内含有内源性病毒(野生型腺病毒可产生辅助病毒样作用,使非重组腺病毒也能 感染细胞),更换冻存的细胞,初代培养的较适用。 3) 建议先进行目的细胞的转染预实验。

文章分享(七)m1A甲基化酶基因竟与mTOR存在可靠的联系?

这篇文章研究分析了五种胃肠道肿瘤(GI)患者的TCGA数据。利用cBioPortal的数据,研究了9种已知的癌症m1A相关酶的分子特征。利用多种生物信息学方法,研究了m1A调控因子对其下游信号通路的影响。为了进一步证实这一调控,还利用已发表的数据库中的RNA-seq数据,研究了m1A writer基因 ALKBH3敲除的效果。

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  • 柚子
  • 发布于 2019-07-29 10:19
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节后第一篇--如何用生信去挖掘新型甲基化预后标记

节后第一篇推送,首先当然是祝大家节日快乐!! 传统意义上,过完初十五,这个年,才算彻底过完。在节日里我们肯定许下了各种美好心愿,节日过完,该向着我们的目标出发了! 拿一

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  • chris
  • 发布于 2019-03-21 12:53
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〖生物技术〗单细胞测序方法大比拼

导读 在单细胞研究的大潮中,新的测序方法层出不穷。不过,很少有人对这些方法进行系统的比对。慕尼黑大学生物学家Wolfgang Enard最近领导团队,在小鼠胚胎干细胞的基因表达研究中比较了一

NGS基础 - 高通量测序原理

NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析、ChIP-seq分析、DNA甲基化分析、重测序分析五部分内容。 NGS基础系列文章包括高通量测序原理,测序数据获取和质量评估,常见文件格式解释和转换4部分。

生物信息毕业生如何走向应用

自扯自蛋

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-08-17 21:04
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怎样使用SangerBox进行投稿选刊

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  • 祝让飞
  • 发布于 2019-12-17 15:16
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2018学术影响力排名前100名期刊推荐!

8月2日,Google Scholar发布了2018年最新的学术期刊影响力排名。

文献分享(9)m6A调控子在33种癌症类型中的分子特征和临床相关性

通过以上分析作者发现m6A调控子存在广泛的遗传改变,并且它们的表达水平与癌症标志相关通路的活性显著相关。此外,发现m6A调控子可能对预后分层有用,将IGF2BP3鉴定为跨多种癌症类型的潜在致癌基因。该文章的结果提供了宝贵的资源,将指导m6A调控子在癌症中的作用的机理和治疗分析。

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  • 柚子
  • 发布于 2019-11-25 20:05
  • 阅读 ( 3264 )

如何将PDF文件内容变为灰色来降低价格?

文件内容色彩变灰来维持价值

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  • 柚子
  • 发布于 2020-08-19 16:26
  • 阅读 ( 3249 )

文献解读(3)what?铁代谢的分子治疗可能对癌症的治疗有帮助?

作者通过对泛癌分析发现铁代谢在不同的癌症类型中都失调,并且这与患者生存显著相关,特别是在KIRC中。这一观察结果在肾癌组织中得到了证实。此外,DFO和erastin可抑制多种肿瘤细胞的增殖,影响多种铁相关基因的表达。因此,针对铁代谢的分子治疗可能对癌症的治疗有帮助。

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  • 柚子
  • 发布于 2019-11-25 10:07
  • 阅读 ( 3249 )

小编:无话可说-----我从未见过如此……细致之文章

最近小编读到一篇关于 m6A 修饰的文章,完全被震撼和折服了!!思路之清晰、手段之全面、机制之详尽,让小编甘愿奉上自己的膝盖 …… 毫不夸张的说够得上 Cell 级别(但是为什么没发 Cell

文献解析(7)胶质瘤MR预测IDH

利用这个神经网络模型,作者分别在训练集、验证集和测试集实现了82.8% (AUC = 0.90)、83.0% (AUC = 0.93)和85.7% (AUC = 0.94)的IDH预测精度。当诊断年龄纳入模型时,训练、验证和测试的准确率分别增加到87.3% (AUC = 0.93)、87.6% (AUC = 0.95)和89.1% (AUC = 0.95)。表明这种深度学习技术能够实现非侵入性的高效准确预测II-IV级胶质瘤的IDH基因型,有助于指导治疗决策。

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  • 柚子
  • 发布于 2019-11-26 14:48
  • 阅读 ( 3240 )

实战系列(三)模仿4分胃癌发病机制和预后关键基因的文章

DOI : 10.3389/fgene.2018.00265我们桑格助手的读者一定明白给 DOI是为什么,如果万一第一次看本公众号的文章,不明白,我稍稍解释一下,通过DOI可以浏览到文献的全文(我们不说下载(#^.^#)桑格助

开挖掘机的老司机告诉你,除了GEO还能挖哪里的数据?

我叫林平之,是一个挖掘机驾驶员,不,应该是莫愁师姐的师弟,呃,有一个小小的问题一直困扰着我。就是要怎么分析别 人家的芯片。GEO虽然好,但感觉Datasets上的芯片真的很少,根本不够用