在R语言中关于目录的问题小结

在敲了很多R脚本,然后需要互相引用的时候就会遇到路径问题了 1、如果获取当前工作目录使用: getwd() 2、获取R 包安装目录使用: .libPaths()[1] 3、获取R脚本当前目录咋整? 这个问题其...

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  • 祝让飞
  • 发布于 2017-09-30 15:13
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三思而后行的基因组项目

基因组做之前的准备工作。

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  • SXR
  • 发布于 2017-03-30 22:08
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一篇曾经10+胃癌亚型预后相关的文章解析

从标题来看做的是基于TCGA数据分析胃癌四个亚型临床意义 n 研究背景: 胃癌在全球范围内最常见的癌症中排名第四,死亡率位居世界第三,每年约723,100人死于该疾病。2014年,TCGA数据...

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  • 调研图
  • 发布于 2019-06-28 10:17
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python:程序输出

关于python程序输出的相关技巧介绍

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  • SXR
  • 发布于 2017-04-20 10:07
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高颜值的相关性计算工具——你爱了吗!

相关性基础知识 “ 相关表和相关图可反映两个变量之间的相互关系及其相关方向,但无法确切地表明两个变量之间相关的程度。 相关系数是用以反映变量之间相关关系密切程度的统计指标。相关系数是按积差方法计算,同样以两变量与各自平均值的离差为基础,通过两个离差相乘来反映两变量之间相关程度;着重研究线性的单相关系数 ”

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  • 柚子
  • 发布于 2020-06-15 15:25
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如何将PDF文件内容变为灰色来降低价格?

文件内容色彩变灰来维持价值

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  • 柚子
  • 发布于 2020-08-19 16:26
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怎样使用SangerBox进行投稿选刊

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  • 祝让飞
  • 发布于 2019-12-17 15:16
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超简单!每个样本只要10元的转录组分析教程

十元十元? 第一次写教程还是要标题党一下。不过十元并不夸张,十元真的买不了吃亏,买不了上当。作为一个临床外科小大夫,写生物分析教程,求专业级别的人放过。看中结果,忽略过程中的瑕疵。...

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  • 娄佳成
  • 发布于 2018-01-18 15:55
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零基础测序分析图表解读大全:老板再也不愁我的文献阅读了! 宏基因组扩增子(箱线,散点,热,曼哈顿,火山,韦恩,三元,网络)

本网内容转载自“宏基因组”公众号,更佳阅读体验、更多相关文章,欢迎点我跳转至公众号。 写在前面 (Introduction) 很多刚接触高通量测序数据分析文章的学生,感觉图表丰富多样高大上,但根...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-10-13 20:10
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分子互作的异常是导致孟德尔疾病的普遍原因

核心观点: 1,Most missense disease mutations appear not to impair protein folding or stability ,2,Interaction profiling helps distinguish disease mutations from non-disease var...

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  • 涣醒
  • 发布于 2018-01-08 20:35
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腺病毒实验5大问题及解决对策

如何解决细胞感染病毒后高死亡率的问题? 1) 一些细胞株有类似E1区活性 若一定要使用该细胞株,改用较低MOI。 2) 细胞内含有内源性病毒(野生型腺病毒可产生辅助病毒样作用,使非重组腺病毒也能 感染细胞),更换冻存的细胞,初代培养的较适用。 3) 建议先进行目的细胞的转染预实验。

生信人简史

哈哈,如果你看到这个标题,千万不要想起咪蒙。小编可是好孩子。 话说也是好多年前的现在,小编懵懵懂懂,傻啦吧唧的选择了这个伟大光荣正确的专业。 那时候天真的认为,等我30岁,小编一定要...

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-06-23 20:58
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文献解读(3)what?铁代谢的分子治疗可能对癌症的治疗有帮助?

作者通过对泛癌分析发现铁代谢在不同的癌症类型中都失调,并且这与患者生存显著相关,特别是在KIRC中。这一观察结果在肾癌组织中得到了证实。此外,DFO和erastin可抑制多种肿瘤细胞的增殖,影响多种铁相关基因的表达。因此,针对铁代谢的分子治疗可能对癌症的治疗有帮助。

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  • 柚子
  • 发布于 2019-11-25 10:07
  • 阅读 ( 4000 )

生物信息毕业生如何走向应用

自扯自蛋

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  • 张海伦
  • 发布于 2017-08-17 21:04
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快速绘制分组小提琴图工具

“小提琴图 (Violin Plot) 用于显示数据分布及其概率密度”

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  • 柚子
  • 发布于 2020-05-26 09:49
  • 阅读 ( 3976 )

节后第一篇--如何用生信去挖掘新型甲基化预后标记

节后第一篇推送,首先当然是祝大家节日快乐!! 传统意义上,过完初十五,这个年,才算彻底过完。在节日里我们肯定许下了各种美好心愿,节日过完,该向着我们的目标出发了! 拿一

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  • chris
  • 发布于 2019-03-21 12:53
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实战系列(三)模仿4分胃癌发病机制和预后关键基因的文章

DOI : 10.3389/fgene.2018.00265我们桑格助手的读者一定明白给 DOI是为什么,如果万一第一次看本公众号的文章,不明白,我稍稍解释一下,通过DOI可以浏览到文献的全文(我们不说下载(#^.^#)桑格助

文献解析(7)胶质瘤MR预测IDH

利用这个神经网络模型,作者分别在训练集、验证集和测试集实现了82.8% (AUC = 0.90)、83.0% (AUC = 0.93)和85.7% (AUC = 0.94)的IDH预测精度。当诊断年龄纳入模型时,训练、验证和测试的准确率分别增加到87.3% (AUC = 0.93)、87.6% (AUC = 0.95)和89.1% (AUC = 0.95)。表明这种深度学习技术能够实现非侵入性的高效准确预测II-IV级胶质瘤的IDH基因型,有助于指导治疗决策。

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  • 柚子
  • 发布于 2019-11-26 14:48
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文献分享(9)m6A调控子在33种癌症类型中的分子特征和临床相关性

通过以上分析作者发现m6A调控子存在广泛的遗传改变,并且它们的表达水平与癌症标志相关通路的活性显著相关。此外,发现m6A调控子可能对预后分层有用,将IGF2BP3鉴定为跨多种癌症类型的潜在致癌基因。该文章的结果提供了宝贵的资源,将指导m6A调控子在癌症中的作用的机理和治疗分析。

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  • 柚子
  • 发布于 2019-11-25 20:05
  • 阅读 ( 3958 )

2018学术影响力排名前100名期刊推荐!

8月2日,Google Scholar发布了2018年最新的学术期刊影响力排名。