生信文章解析（第六篇）揭示MuBC的分子结构
通过研究MuBC和IDC样本之间基因表达，拷贝数和突变水平的差异，揭示MuBC的分子结构，表明MUC2基因的DNA甲基化异常可能是MuBC胞外粘蛋白产生的原因。
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- 柚子
- 发布于 2019-08-15 10:24
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柚子
肿瘤研究不能不知道的TCGA数据库挖掘工具大全，TCGA再也不愁！
TCGA数据库的挖掘工具层出不穷，从数据下载到数据挖掘，这里小编给大家整理一份官网的数据挖掘工具大全： http://www.cancerimagingarchive.net/ The Cancer Imaging Archive (TCIA) TCIA存储...
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- 余繁荣
- 发布于 2019-03-21 12:36
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余繁荣
桑格助手帮你更轻量级的检索信息
有那么一个公众号，不管你撩还是不撩，他都在那里，没有几次推送，但是当你需要知识时，他就会出现在你身边。 比如我想知道cox是什么，就回复cox如下： 他把生物医学领域几百个公众号教程啃...
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- 祝让飞
- 发布于 2018-06-14 09:20
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祝让飞
数据挖掘CeRNA网络构建数据预处理
TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。本节主要数据准备和预处理。
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- 调研图
- 发布于 2018-11-16 12:58
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调研图
数据挖掘系列二开篇如何构建CeRNA
TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。本讲非常详细解读基本TCGA数据库为后续分析打下一个坚实基础。
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- 调研图
- 发布于 2018-11-16 11:14
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〖生物技术〗单细胞测序方法大比拼
导读 在单细胞研究的大潮中，新的测序方法层出不穷。不过，很少有人对这些方法进行系统的比对。慕尼黑大学生物学家Wolfgang Enard最近领导团队，在小鼠胚胎干细胞的基因表达研究中比较了一
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- 生信分析流
- 发布于 2018-09-03 10:27
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生信分析流
富集分析结果展示（二）——富集分析圈图
“做cox比例分析和KM曲线结合分析，阈值该怎么选取，数据是否需要标准化等等问题的解决方法”
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- 柚子
- 发布于 2020-05-26 10:06
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生信文献解读（3）乳腺癌组织病理学与蛋白基因组学相关分析
这篇文章分析揭示了整合形态学信息和分子数据，使人们对组织形态学调控和蛋白质这一过程有更深的理解，有助于对癌症生物学和预后预测产生新的见解。
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- 柚子
- 发布于 2019-08-26 14:54
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医学博士的开题神器，了解一下？
最近有一些博士与小编讨论开题问题。 小编就会问到那你都有什么准备呢，做了哪些前期工作，得到的答案是啥也没有... 原因很复杂，但主要原因是没有足够的时间去看文献和前沿的报道，
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- 生信分析流
- 发布于 2019-06-25 13:39
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【助研】【博后】【中科院】中科院心理所生物信息实验室助研及博士后招聘启事
王晶研究员研究组主要从事精神疾病多组学数据挖掘的生物信息技术开发以及精神疾病的候选分子标志物研究。目前因研究工作需要，招聘如下人员： 一、岗位需求：助研1人，岗位博士后1人 二...
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- bioinfo
- 发布于 2018-03-24 15:53
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bioinfo
NC：自体免疫水泡皮肤病中鉴定基因与微生物组互作(微生物组关联分析MWAS)
之前我们平台分享过《Nature：宏基因组关联分析》综述，让大家系统的了解这一领域。同时还分享过一篇《GigaScience:谷子产量与微生物组关联分析》是植物领域中的优秀工作。今天再分享一篇在动物...
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- 刘永鑫
- 发布于 2018-01-06 08:41
- 阅读 ( 4364 )
刘永鑫
GEO 芯片数据转换器 转换出的gene symbol和官网给的注释文件不一致
GEO 芯片数据转换器 转换出的gene symbol和官网给的注释文件不一致，可能原因是GEO上数据所用平台种类比较多， 我用的数据平台是GPL6947,大家注意下吧。 TCGA的gene symbol转换我没有去试验,个...
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- 戴瑨
- 发布于 2018-03-26 11:25
- 阅读 ( 4358 )
戴瑨
SXR
记一次ORFfinder本地化所遇到的问题
本地化ORFfinder本来是一件相当简单的事情，NCBI已经做的足够简洁，下载ORFfinder二进制文件，然后就可以了，但是我这边却遇到了难题。
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- deepxin
- 发布于 2017-09-18 19:47
- 阅读 ( 4316 )
deepxin
【资源网站集合2】免费在线编辑工具
【往期回顾】 点击文字跳转： 【功能群】 —专利检索下载网站 SCI Translate 8：科技论文全文翻译利器 在校外也可以访问Web of Science 五款在线 PDF编辑工具（几乎解决所有的PDF问题） PPT模板
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- 调研图
- 发布于 2018-09-17 16:26
- 阅读 ( 4296 )
张海伦
一只临床狗如何从零基础学习生信成为生信大神的？敬请期待连载
从来没有想到自己会有这样的幸运，刚刚接到生信人的邀请，成为第一批临床同学加入到生信逆袭训练营，之后的几个月，我将经常性的骑车到生信人位于杭州余杭的总部学习。 对不起，我现在的心情...
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- 王国胜
- 发布于 2017-10-24 22:11
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王国胜
NGS基础 - 高通量测序原理
NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析、ChIP-seq分析、DNA甲基化分析、重测序分析五部分内容。 NGS基础系列文章包括高通量测序原理，测序数据获取和质量评估，常见文件格式解释和转换4部分。
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- shengxinbaodian
- 发布于 2018-08-27 20:22
- 阅读 ( 4207 )
shengxinbaodian
Windows不用虚拟机或双系统，轻松实现linux shell环境：gitforwindows
windows缺少shell命令支持 用过Linux服务器分析数据的小伙伴，一定对Linux强大Shell命令所折服，经常会感觉windows缺少这些命令而感觉不方便。 还有想学习Linux Shell命令的小伙伴，一直没有...
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- 刘永鑫
- 发布于 2018-02-11 23:05
- 阅读 ( 4203 )
文章分享（七）m1A甲基化酶基因竟与mTOR存在可靠的联系？
这篇文章研究分析了五种胃肠道肿瘤（GI）患者的TCGA数据。利用cBioPortal的数据，研究了9种已知的癌症m1A相关酶的分子特征。利用多种生物信息学方法，研究了m1A调控因子对其下游信号通路的影响。为了进一步证实这一调控，还利用已发表的数据库中的RNA-seq数据，研究了m1A writer基因 ALKBH3敲除的效果。
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- 柚子
- 发布于 2019-07-29 10:19
- 阅读 ( 4198 )
